Missing coverage evidence...
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*	*	÷	NC_007793	2490098	2490106	9	20 [0]	[0] 3	SAUSA300_RS12790	hypothetical protein

TTGATTGGTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATTATCTTTATTATCTTTGTTTACGTCTT  >  NC_007793/2489998‑2490105                                                                                                    |         ttGATTGGTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttctt          <  1:5357723/100‑1 (MQ=255) cgatctGGTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCGTTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttctt          <  1:4313130/95‑1 (MQ=255)      tGGTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatctt     <  1:6561238/100‑6 (MQ=39)       ggTTTTTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:1082271/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAGTTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:409162/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:2616429/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:6287525/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:2314584/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:4309311/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:3438525/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:3317584/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:2971713/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTCGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:4913765/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTCGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:4928519/100‑7 (MQ=38)       ggTTATTATTTGTTCGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:4943902/100‑7 (MQ=38)       ggTTACTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:595381/100‑7 (MQ=38)       agTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatcttt    <  1:1821361/99‑7 (MQ=38)         ttattaTTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatctttag  <  1:4896058/100‑9 (MQ=38)         ttattaTTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatctttag  <  1:5039226/100‑9 (MQ=38)         ttattaTTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATCATCTTTATTAtctttcttatctttag  <  1:2570196/100‑9 (MQ=38)                                                                                                    |         TTGATTGGTTATTATTTGTTTGGTTTTGGTCATTGTTTGTTGCATTTGAATTAGATTGTTGCTGGTTATCGTTTGCACTATTATCTTTATTATCTTTGTTTACGTCTT  >  NC_007793/2489998‑2490105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑