| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 616,728 | +TTC | coding (2372/4146 nt) | SAUSA300_RS02920 → | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 616,727 | 1 | . | C | 86.9% | 160.1 / 54.9 | 137 | coding (2371/4146 nt) | SAUSA300_RS02920 | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (17/1); new base C (119/0); total (136/1) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.64e-01 | |||||||||||
| * | NC_007793 | 616,727 | 2 | . | T | 86.9% | 169.9 / 44.6 | 137 | coding (2371/4146 nt) | SAUSA300_RS02920 | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (17/1); new base T (119/0); total (136/1) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.14e-01 | |||||||||||
| * | NC_007793 | 616,727 | 3 | . | T | 86.9% | 170.9 / 44.6 | 137 | coding (2371/4146 nt) | SAUSA300_RS02920 | serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (17/1); new base T (119/0); total (136/1) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAACTGAAAAAGGTATTTCAGGCGTAACAGT > NC_007793/616629‑616818 ||| ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAc‑‑‑ctg < 1:314720/100‑3 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:1005359/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:6500643/1‑100 (MQ=255) ggTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑Caa > 1:863172/1‑100 (MQ=255) aaaaGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATaacacacct < 1:1933035/100‑8 (MQ=255) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2110733/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2278445/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:2247409/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5879843/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5483742/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5347958/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5339909/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5236028/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4728212/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:334659/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:3413456/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4573910/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:3618049/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4354803/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4224633/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:104246/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1078459/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1306428/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:134454/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1419042/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:6463066/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1623825/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:176072/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1627629/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1758615/8‑100 (MQ=9) tggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGAACGATTCTAAt > 1:548855/8‑100 (MQ=9) tggcacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:1618881/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:6146463/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:4496684/8‑100 (MQ=9) aggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAAt > 1:5674013/8‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGTTAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATAGTACGATTCTAATa > 1:4927847/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAGAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6402860/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5353684/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6635829/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5283029/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:767473/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5410959/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5896878/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4608962/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5922375/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:933364/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:5951933/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:6126280/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:4301262/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:625212/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3898412/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1311091/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1474613/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:163664/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:1641915/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:179796/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:195907/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2365015/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:256506/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:29410/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2965223/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:2969572/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3239940/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3716747/7‑100 (MQ=9) ggtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3489732/7‑100 (MQ=9) agtacaattaAAGATGCTGACAACTGGACTTTAGATAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATa > 1:3507286/7‑100 (MQ=9) caTGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGGTGGTAAga > 1:2394225/2‑99 (MQ=255) gATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAGATAAAGATCGGAAgagcacacgtc > 1:201334/1‑90 (MQ=18) gACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGAATTCAACTGaaaaa > 1:4827596/1‑100 (MQ=255) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:6087349/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:2174082/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:4724715/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:458013/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5568816/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5595585/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5867380/1‑100 (MQ=9) tAGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGAGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5428455/1‑100 (MQ=9) gtgTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:5520636/3‑100 (MQ=9) gaGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtt > 1:6236295/2‑100 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAGATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGGACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:1982653/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTATGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3317493/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:6352395/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:6413507/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3691568/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:790008/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:4218874/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2394953/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2160550/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2165247/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:5767901/1‑99 (MQ=2) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:4616051/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:5669408/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2576655/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:280835/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:2811448/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:4761131/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3098494/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:3146026/1‑99 (MQ=9) aGTGGATTCTACAAAACGCCTTCTAAATACAGCTTAGGTGATTATGTATGGTACGATTCTAATAAAGATGGTTACCAAGACAATGATGAAAAAGGTAtta > 1:5089173/1‑99 (MQ=9) aCAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAACTGAAAAAGGTATTTCAGGCGTAACAGt > 1:3409248/1‑100 (MQ=255) ||| CTGGTAGCGACATTGAAAAAGACTCTAATGGTTTAACAACAACAGGTGTTATTAATGGTGCTGATAACATGACATTAGATAGTGGATTCTACAAAACAC‑‑‑CAAAATATAATTTAGGTAATTATGTATGGGAAGATACAAATAAAGATGGTAAGCAGGATTCAACTGAAAAAGGTATTTCAGGCGTAACAGT > NC_007793/616629‑616818 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |