Predicted mutation
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RA	NC_007790	258	G→A	intergenic (–/‑22)	– / → SAUSA300_RS14705	–/replication protein

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*	NC_007790	258	0	G	A	100.0%	124.2 / NA	43	intergenic (–/‑22)	–/SAUSA300_RS14705	–/replication protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (43/0);  total (43/0)

GTTTTGTAAATCAAAATTATGTCCGGTTTGTAATTGGAGACGTGCTATGAAAAATAGTTATCAAGCTCAAAAAGTGATTGAAAAAGTAATTAAGGAAAAGCCAAAAGCACGTTGGTTGTTT  >  NC_007790/234‑354                         |                                                                                                 cttctggtaaTCAAAGTTATGTCCAGTTTGTAATTGGAGACGTTCTATGAAAAATAGTTATCAATCCCAAAAAGTGATTGAAGAAGTGTTTAAAGAAAAg                       >  1:4033750/9‑100 (MQ=255)   tctggtaaTCAAAGTTATGTCCAGTTTGTAATTGGAGACGTTCTATGAAAAATAGTTATCAATCCCAAAAAGTGATTGAAGAAGTGTTTAAAGAAAAGcc                     >  1:99043/7‑100 (MQ=255)   tctggtaaTCAAAGTTATGTCCAGTTTGTAATTGGAGACGTTCTATGAAAAATAGTTATCAATCCCAAAAAGTGATTGAAGAAGTGTTTAAAGAAAAGcc                     >  1:1443954/7‑100 (MQ=255)   tctggtaaTCAAAGTTATGTCCAGTTTGTAATTGGAGACGTTCTATGAAAAATAGTTATCAATCCCAAAAAGTGATTGAAGAAGTGTTTAAAGAAAAGcc                     >  1:4453865/7‑100 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑