| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 863,134 | G→A | intergenic (‑11894/‑60625) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 863,134 | 0 | G | A | 100.0% | 192.7 / NA | 47 | intergenic (‑11894/‑60625) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/24); total (23/24) | |||||||||||
TACTGCAACGATTAACACGGCAACAGCAATAGCGATCAAACCATATTCAATTGCAGTCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGTGTTATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTAAATGAGCTATTTCTACTTTCTCTATTGATTTTACAGTAAATTTACAACTTTTAACTTTAATTACAAAAACACTTAAATATGTGTGGATTTAGAG > 1/862888‑863344 | tACTGCAACGATTAACACGGCAACAGCAATAGCGATCAAACCATATTCAATTGCAGTCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGtattat < 1:793531/251‑1 (MQ=255) 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TACTGCAACGATTAACACGGCAACAGCAATAGCGATCAAACCATATTCAATTGCAGTCACACCTGCTTGATTTTCTCTGAAAGAACGGATTGCTTCAGCTGCTTTGATGTATGCTTTAGTAGTTAAAGTATTTAACATTGTCTTAATGCTCCTTTGTTGTTTATAGAAAATAAAATTCAAGAATCCTTGAGTTTGAACTTAGTGTCATTTATTTAATAAGCTTGTGGAATTAAATAAACGACCGGTGTTATAGTCCTGAAAAATTAAAATGCAAGTTTTTTTAGAATAATAAATTCACTATGTATATGTACGTATTGTGATTGCGAAAACTTTTTAATTAACAGTATGTTAAGGGTTATTGTAAATGAGCTATTTCTACTTTCTCTATTGATTTTACAGTAAATTTACAACTTTTAACTTTAATTACAAAAACACTTAAATATGTGTGGATTTAGAG > 1/862888‑863344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |