| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,337,412 | (CACCT)7→6 | intergenic (+4794/+249717) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1337384 = | 3 (0.030) | 42 (0.550) | 30/392 | 1.5 | 94.8% | intergenic (+4766/+249749) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | = 1337378 | 2 (0.030) | intergenic (+4760/+249755) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
CTTCAAAGACGACGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCC > 1/1337128‑1337621 | cTTCAAAGACGACGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATg > 1:611961/1‑251 (MQ=255) acgacgTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGcctcacc > 1:543101‑M2/1‑243 (MQ=255) cgacgTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGcctcacctc > 1:808116‑M2/1‑242 (MQ=255) cgTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGGGCGGTTAAAATTCGTAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAGAAATAACTTGACAGCTAGATTGTAAAAGGAAAAAAATATGcctatcctcacc > 1:144683‑M2/1‑239 (MQ=255) 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1:662802‑M2/251‑167 (MQ=255) ctctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAAtt > 1:562796/1‑251 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGcctcacctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaa < 1:412640‑M2/248‑174 (MQ=255) tttACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGcctcacctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaactgca < 1:449251‑M2/251‑179 (MQ=255) 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CTTCAAAGACGACGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCC > 1/1337128‑1337621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |