| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 243948 | 99 (1.100) | 4 (0.050) | 4/438 | 8.1 | 4.1% | intergenic (+107829/+19205) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 243955 | 93 (1.080) | intergenic (+107836/+19198) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TGGCAGGATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTTTATTATTATGAATAATAAGAGATCTCTTTCGCCTTATTGGTAATGCGTGTACCGGCCTTGCCTTTCACAATATCAACAATGTCAGAAAGTGATCCGATGACTGCATCTTTTCCCGTATGACGTGCAAAATTTACCGCCGCTTGCACCTTCGGTCCCATGGAACCGGCAGCAAAAGCTAATTTTTCAATTTCATCAG > 1/243706‑244205 | tGGCAGGATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATc < 1:573858/250‑1 (MQ=255)tGGCAGGATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATc < 1:448821/250‑1 (MQ=255) ggCAGGATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAg > 1:221682/1‑251 (MQ=255) gCAGGATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAg < 1:241499/250‑1 (MQ=255) ggATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTa > 1:788769/1‑250 (MQ=255) gATAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACg > 1:363794/1‑251 (MQ=255) tAGGTTTTATCTTGTTCGCCATAGGTCTTCACTACAAACATTTTGTCAGTCATACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGcc < 1:355600/251‑1 (MQ=255) 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gtcaTACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTttat > 1:83530/1‑251 (MQ=255) gtcaTACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTttat > 1:151176/1‑251 (MQ=255) gtcaTACTATAAGTCAATTTAGAATATGAACCTGACGGAATAACCCAGGTGAGTCCCACAGCAAGGATGAGAATAAAGAATAAAATCGTAAATGCCGATGGGAAATTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTttat > 1:156211/1‑251 (MQ=255) 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1:435698/1‑250 (MQ=255) aTTAAAGGTCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTTTATTATTATGAATAATAAGAGATCTCttt > 1:478210/1‑173 (MQ=255) tCTTTTTTTGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTTTATTATTATGAATAATAAGAGATCTCTTTCGCCTTATTGGTAATGCGTGTACCGGCCTTGCCTTTCACAATATCAACAATGTCAGAAAGTGATCCGATGACTGCATCTTTTCCCg < 1:76372/251‑1 (MQ=255) ttttGAGTAGACGCTTCCATAACAGACTCCTCGTCAATACAACAGTTTTGTTTGGCAAGTTGGCGTAACTTTCTATCAGTTACGCCAGCCGCGCATTTTACTTTGAACCGCTGAATTTTTCAAAGTGCTTTTATTATTATGAATAATAAGAGATCTCTTTCGCCTTATTGGTAATGCGTGTACCGGCCTTGCCTTTCACAATATCAACAATGTCAGAAAGTGATCCGATGACTGCATCTTTTCCCGTATGa < 1:672774/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |