| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 595447 | 71 (1.050) | 12 (0.190) | 6/436 | 4.6 | 15.7% | coding (142/312 nt) | unknown | Zn‑ribbon‑containing, possibly RNA‑binding protein and truncated derivatives |
| ? | 1 | = 595583 | 61 (0.940) | coding (6/312 nt) | unknown | Zn‑ribbon‑containing, possibly RNA‑binding protein and truncated derivatives | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAATTAAACGTAATAATTCCCGCTGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCTTATGATAATTTCTCACAAAAGCAAACATCATTTTTGGTCGCAACTGCTGCTTGGCATGCTTGCGATTTTTGTTTTGCCTGTCGGTCAGGAACTGAATTATTCCTCTTCCGTCGGCAGAGAAAATTATCAAAACGCCCAGCAACAAAA > 1/595345‑595825 | gAATTAAACGTAATAATTCCCGCTGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTg > 1:111083/1‑251 (MQ=255) aaTTAAACGTAATAATTCCCGCTGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGcc < 1:333275/247‑1 (MQ=255) ttAAACGTAATAATTCCCGCTGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGTAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGttt < 1:264319/251‑1 (MQ=255) ttAAACGTAATAATTCCCGCTGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGttt < 1:335556/251‑1 (MQ=255) gTAATAATTCCCGCTGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGc > 1:265285/1‑250 (MQ=255) tGACGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAata < 1:209016/251‑1 (MQ=255) aCGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTGACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAatat < 1:5114/250‑1 (MQ=255) aCGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAatat < 1:348035/250‑1 (MQ=255) cGAAACAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATAttt < 1:633216/251‑1 (MQ=255) cAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGAc < 1:20165/251‑1 (MQ=255) cAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGAc < 1:130308/251‑1 (MQ=255) cAAAAAACTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGAc < 1:30450/251‑1 (MQ=255) aaCTTTGCCGCACCATGGCATTCGCCACTTCAATGCGCAAACTGTTTTGTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGt < 1:411231/251‑1 (MQ=255) 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gTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCtt > 1:567498/1‑251 (MQ=255) gTTCTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTATTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCtt > 1:593596/1‑251 (MQ=255) cTATATTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCTTATg > 1:618265/1‑251 (MQ=255) atatTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTTATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGAc < 1:220318/193‑1 (MQ=255) atatTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCTTATGAt > 1:424077/1‑251 (MQ=255) atatTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCTTATGAt > 1:329653/1‑251 (MQ=255) atatTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCTTATGAt > 1:442435/1‑251 (MQ=255) atatTGGCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATACCGACAATTTTTTGATATTGAGATCCTTATGAt > 1:146228/1‑251 (MQ=255) ggCAATGCGATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAACGCATTGCCTTGTTTTCCGCCTTTTCGCCCTAATATTTATGACATTGTAGCGAATTTCCGCTACAATAc > 1:556412/1‑214 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |