| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 515551 | 163 (1.440) | 8 (0.070) | 5/436 | 8.1 | 5.2% | intergenic (+152134/‑56468) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 516037 | 132 (1.190) | intergenic (+152620/‑55982) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GATGTTGGGTTCCACCTATTACGCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTGGCGGAAATGGGTGGCATTATTTTTGACTTGAATTATCAACCGCTGACTTATAATAAACGGGAATCTTTCGTCAATCCGAATTTTGTCATGGGAATCACGCAGGATTTTCCGTGGGATAAAATCTTTCACTCCAATTAATTAGAGTAATTGGAAATCCGGAATGATTTTACCTATTATACGAAGCAGTTATT > 1/515788‑516279 | gATGTTGGGTTCCACCTATTACGCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACAtt > 1:761558/1‑250 (MQ=255) aCCTATTACGCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCAc < 1:29300/251‑1 (MQ=255) aCCTATTACGCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCAc < 1:352761/251‑1 (MQ=255) ttACGCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTg < 1:87019/251‑1 (MQ=255) cGCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAAt > 1:1008433/1‑251 (MQ=255) gCCATGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATg > 1:168220/1‑251 (MQ=255) aTGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGt > 1:89639/1‑234 (MQ=255) aTGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGa > 1:361694/1‑251 (MQ=255) aTGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGa > 1:563929/1‑251 (MQ=255) tGCAGGGTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGAt < 1:265195/251‑1 (MQ=255) gggTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATa > 1:869914/1‑248 (MQ=255) gTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGc > 1:314707/1‑250 (MQ=255) gTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGc > 1:258888/1‑250 (MQ=255) gTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGc < 1:537236/250‑1 (MQ=255) gTTTCGGTGCGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGc > 1:975388/1‑250 (MQ=255) cGTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCgag > 1:594596/1‑251 (MQ=255) gTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCAc < 1:512714/222‑1 (MQ=255) gTATAAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATggg > 1:506246/1‑233 (MQ=255) tataAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGAt > 1:666051/1‑251 (MQ=255) tataAACACCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGAt > 1:1001473/1‑251 (MQ=255) acacCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTAc < 1:362413/251‑1 (MQ=255) cacCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCG‑AAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTa > 1:650622/1‑248 (MQ=255) acCATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTa > 1:710449/1‑248 (MQ=255) ccATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGt > 1:812018/1‑208 (MQ=255) ccATGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTgg > 1:991124/1‑251 (MQ=255) aTGACGGGCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCgaga > 1:415159/1‑240 (MQ=255) gggCAGCACCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTGGCGGAAAt > 1:986067/1‑251 (MQ=255) caCCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTGGCGGAAATGGGt < 1:446955/249‑1 (MQ=255) caCCTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTGGCGGAAATGGGt < 1:773977/249‑1 (MQ=255) ccTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATggg < 1:838229/209‑1 (MQ=255) ccTTAAATTAGCCTTCCATGATATTCAAGCGGACAATGCCTTGCGTATTGCTGTGGGTTCCGCCGCCGCAGCCGAAAAAGTGCGGTCGATTTTAAATAAGAATTTGGCTTACGAATTTCATATTTGCGGATCCAGCGGGTTAAAAAGCACACTGGTGGCAGACGGCGTATGCGATTGCTACATTCGCTTGGGTTGCACCGGTGAATGGGATACTGCCGCTTCCGAGATTTTACTGGCGGAAATGGGTGGCa > 1:660203/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |