| New junction evidence | |||||||||||
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ATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTA > 1:873698/1‑249 ATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTA > 1:218821/1‑249 ATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTA > 1:1084133/1‑249 ATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTA > 1:725151/1‑249 ATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAG < 1:1005774/123‑1 ATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGAAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTA > 1:942025/1‑249 TGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTC < 1:312364/251‑1 TTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTCC < 1:1045381/250‑1 CTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTCCCGCCGATGTA > 1:582260/1‑251 CTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTCCCGCCGATGTA > 1:412662/1‑251 CTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTAC > 1:662465/1‑231 CTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCC > 1:6525/1‑83 TATT‑GGATATTCCAGCTTTTTTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGAATTAATAGATAAAGCAAAATCAACTGCCGACGAAATCATAAGAGACCAAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAGTCTTTTCTAATATTTTCCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTCCTCCCGCCGATGTAT < 1:375162/251‑1 ATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAAT < 1:917821/170‑1 T‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTCCCGCCGATGTATCgt > 1:749826/1‑249 TATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTAAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATAAATAGAAAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTAAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGAAAAAGCGTTTCTAATAATTTCCCCACGGTGGGAACCGCAGCTACGGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTCCCGCCGATGTATCgtatct < 1:166082/251‑7 TTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTG < 1:716449/174‑1 TTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATAC > 1:613505/1‑141 CTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGAC > 1:300252/1‑134 GAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAG < 1:108774/43‑1 GGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCC > 1:171741/1‑49 GATTTCTAAAAAAGAAAAGGATGCAAGGAATTAATAAAAAAAGCCAGACCAACTGCCGACAAAATCATTAGAGCCCAAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTCCCCACAGTGGAAATCGCAGCTACTGAAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTCCCTGCTACTCCCGCCGATGTATCgtat < 1:795453/219‑5 CTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGAC > 1:421840/1‑185 CTTAAAAAGCAAAGGATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGC > 1:129981/1‑180 AAACAAGTAAAAGAAAACATATATAGCAAAATCATTAAAGCTCTTGATATTAAAAATGCGCATCAAATAGGCAAGGAGTTACAGGACGAAATAGACAAAGAGCAGCCGCGATGGTTTGTTGAATGGTACAAATCAACGCTTGAAAAAGCAACCGGACAAAAATTAAATTTTTACACCTATGTTAGCGTAACTATT‑GGATATTCCAGCGTTTCTTTATGGGTTGAGGTAGATTTCTTAAAAAGCAAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/2102278‑2102524‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATGCAAGGCATTAATAGATAAAGCCAGATCAACTGCCGACGAAATCATTAGAGACCTAAAAAATTTAAAAGATACTATTTTGTCCGTTGATACAGACAAAGCGTTTCTAATAATTTTCCCACAGTGGGAATCGCAGCTACTGGAAAGTTTGCCGCCCCGTAAAGCGGGACTACCTGCTACTCCCGCCGATGTATC‑‑‑‑‑‑ > 2/1‑196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |