| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 132241 | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/412 | 8.9 | NA | noncoding (1287/3023 nt) | unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 132346 | NA (NA) | noncoding (1182/3023 nt) | unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CTCCGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGGCGTATCACTAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/131975‑132241‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caggcgtatcactaataCGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGACCA < 1/132346‑132100 CTCCGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAAC < 1:45269/251‑1 CCGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAG > 1:929664/1‑251 CGTCCCCACATCGCATCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATTTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGG < 1:821246/251‑1 CGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGG < 1:81257/251‑1 CGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGG < 1:185222/251‑1 CGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGG < 1:545542/251‑1 CGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGG < 1:693978/251‑1 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TCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGGCG < 1:710219/251‑1 TCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGGCG > 1:63085/1‑251 ACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGGCGTATCA < 1:742961/251‑1 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CACTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAG > 1:598707/1‑251 CACTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAG > 1:836482/1‑251 CACTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAG > 1:356589/1‑251 CACTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGC > 1:558598/1‑205 CACTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATC < 1:158743/191‑1 ACTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGA > 1:312901/1‑251 CTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTTATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGA > 1:621719/1‑250 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CTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGA > 1:444324/1‑250 CTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGA > 1:127122/1‑250 CTAATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGA > 1:147720/1‑250 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AATACGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGACCA > 1:307403/1‑251 CTCCGTCCCCACATCGCAGCTTTACCAAGTACGGGAATATTAACCCGTTTCCCATCGACTACGCTTTTCAGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACCCTGCCCCGATTAACGTTGGACAGGAACCCTTGGTCTTCCGGCGAACGGGTTTTTCACCCGTTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTGTGATACGTCCAGCATACTTCTCAATACACCTTCTTCCGCTTACACAACGCTCCCCTACCCAACAGGCGTATCACTAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/131975‑132241‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caggcgtatcactaataCGCCTTACGATTAACAACTTGCGAAACGAAGAGAAGCAAGTTGGTCAAGCGCCAAACACGTTGAGACGGAAGTCATGACGGGAAGTGCGGTTGGGAATTGAGGAATATTAGTGATACGCCTGTT‑GGGTAGGGGAGCGTTGTGTAAGCGGAAGAAGGTGTATTGAGAAGTATGCTGGACGTATCACAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAACGGGTGAAAAACCCGTTCGCCGGAAGACCA < 1/132346‑132100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |