| New junction evidence | |||||||||||
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CATTTTATTGTCCTTTTTTGAGTAATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGA < 1:643880/251‑1 ATTTTATTGTCCTTTTTTGAGTAATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAAT < 1:451243/232‑1 ATTTTATTGTCCTTTTTTGAGTAATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCCCTTTTCGGGGCGGG‑CAACTTTCCCGTAGCTGCGGTTCCCCCTGTGGGAAAATTATTAG > 1:209824/1‑188 CCTTTTTTGAGTAATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCGCCTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGGAAAATATTAGAAAAGCTTTttt > 1:706067/1‑187 TTTTTGAGTAATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGA < 1:170076/237‑1 ATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTTCGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGGAAAATATTAGAAAAGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTATGTCTCTAATGATTTTGTCGGCAGTTGATCTGGCTT > 1:299609/1‑251 ATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGA < 1:790988/227‑1 ATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTAT < 1:85818/200‑1 ATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGGTCCGCCTTACCGGGGGGC‑CAACTTTCCAGTAGCTGCGGTTCCCCCTGTGGGGAAATTATTAGAAACGCCTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGAATC‑TTTTTAATTTTTTAGGTCTCTAAAGATTTTGTCGGCAGTTGATTTGGCTT > 1:239617/1‑251 ATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGGAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGGGGC‑AAACTTTTCAGTAGCTGCGGTTTCCACTGTGGGGAAAATATTTGAAAAGCTTTGTC‑TGTATCAACCGACAAAATAGTATCTTTTTAAATTTTTT‑TGTCTCTTATGATTTTGTCGGCAGGTGATCTGGg > 1:520745/1‑248 ATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGGAGCAGGGAGTCCCGCTTTTCGGGGGGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGGTTCCCACTGTGGGGAAAATATTAGAAAAGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGGATC‑TTTTAAATTTTTTTGGTCTCTTATGATT > 1:502875/1‑229 GGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTAT < 1:546260/193‑1 CCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCGCTTTACGGGGGGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGGTTTCCCCTGTGGGGAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTTGGTCTCTAATGATTTTGTCGGCAGTTGATCTGGCTTTATCTATTta > 1:494321/1‑249 CTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCGCTTTTCGGGGGGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGGTTCCCCCTGTGGGGAAATTATTAGAAACGCTTTTTC‑TTTATCAACGGACAAAATAATATC‑TTTTTAATTTTTTTTGTCTCTAATTATTTTGTCGGGAGGTGATCTGGCTTTTTTTATTAAT > 1:622878/1‑251 CTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAAATTTTCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGGAAATTATTAGAAAAGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTTAATTTTTTTGGGCTCTAATGATTTTGTCGGCAGTTGATCTGGCTTTTTTTATTAAT > 1:545698/1‑251 CTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGAT > 1:436127/1‑68 CACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTAT < 1:370111/187‑1 CACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTAT < 1:279680/187‑1 CACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAAT < 1:793834/182‑1 CACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAAT < 1:502030/182‑1 CACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCGCTTTTCGGGGCGGC‑AAACTTTTCAGTAGCTGCGGTTCCCACTGTGGGGAAATTATTAGAAACGCTTTTTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTATGGCTCTAATGATTTCGGCGGCAGTTGATCTGGCTTTttttatttatt > 1:388126/1‑239 CGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACG < 1:479763/172‑1 GGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGGAGGAGGTAGTCCCGCTTTACCGGGGGGC‑AAACTTTTCAGTAGCTGCGGTTTCCACTGTGGGGAAATTATTAGAAAAGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATT‑TTTTAAATTTTTTATGTCTCTAATGATTTCGTCGGCAGATGATCTGGGTTTTTTTATTAATTCCTTtcctc > 1:389194/1‑245 GCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGATTTCGTCGGCAGTTGATCTGGCTTTATCTATTAATGCC < 1:3065/242‑1 GCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCGCTTTACGGGGGGGC‑AAACTTTTCCGTAGCTGCGGTTTCCCCTGTGGGGAAAATATTAGAAACGCCTTTTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGGATC‑TTTTTAATTTTTTTGGTCTCTAATtat > 1:420817/1‑202 GGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTTCGGGGGGGC‑AAAATTTCCAGTAGCTGCGGTTCCCACTGTGGGGAAATTATTTGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGAT > 1:417251/1‑200 TGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCCCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTTCCGTAGCTGCGATTCCCCCTGTGGGGAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGGATC‑TTTTTAATTTTTTTGGTCTCTTATGATTTCGTCGGCAGGTGATCTGGCT > 1:1039353/1‑218 GGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGGGTAGCAGGGAGTTCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGGTTCCCACTGTGGGGAAATTATTAAAAAAGCTTTGTC‑TGTATCAACGGGCCAAATAGTATC‑TTTTTAATTTTTTTGGTCTCTTATGATTTCGTCGGCAGTTGATCTGGCTTTATCTATTAATTCCTTTCATCcttttctttttt > 1:928384/1‑239 GGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGGAGTCCCCCTTTTCGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGGTTTCCACTGTGGGGAAATTATTAGAAAAGCTTTTTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGGATC‑TTTTTAATTTTTTTGGTCTCTTATGATTTCTTCGGCAGTTGATCTGGCTTTTTCTATTAATTCCTTGCATCcttttctttttt > 1:770469/1‑239 GGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAAT < 1:810617/157‑1 GGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGGAGCAGGGAGTCCCGCTTTACGGGGCGGG‑AAACTTTTCAGTAGCTGCGATTCCCCCTGTGGGGAAAATATTAGAAACGCTTTTTC‑TGTATCAACGGACAAAAa > 1:902128/1‑155 GTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGATTTCGTCGGCAGTTGATCTGGCTTTATCTATTAATGCCTTGCATC < 1:919177/206‑1 GTCTAGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAA < 1:329015/90‑1 AGATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATC < 1:713584/113‑1 ATACGATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAAT < 1:613462/123‑1 TGCAACGACCAATCGTCACCTCTGGTGATAATAACCAAATACGGATTATCTCGGTGAGTTTCGCCCACTAACACCAGTTTACACTTATCCCCCGATTGCGTCATACCGTAATTGCCATTTAAAAACGCGTGTTTTTCTTGTTCATTCAACATTTTATTGTCCTTTTTTGAGTAATAAAAAGGCCCTCACGTGGAGGGCTTGGGGTTGGTTAGGGTTGTTTATTTCTTTGGCTTGTATTTGTCTAGATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/249‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATACATCGGCGGGAGTAGCAGGTAGTCCCGCTTTACGGGGCGGC‑AAACTTTCCAGTAGCTGCGATTCCCACTGTGGGAAAATTATTAGAAACGCTTTGTC‑TGTATCAACGGACAAAATAGTATC‑TTTTAAATTTTTTAGGTCTCTAATGATTTCGTCGGCAGTTGATCTGGCTTTATCTATTAATGCCTTGCATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 2/196‑1 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |