| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1337282 | 26 (0.370) | 27 (0.320) +CCTCA |
14/358 | 3.1 | 47.1% | intergenic (+4760/+264518) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1337283 = | 30 (0.350) | intergenic (+4761/+264517) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TTCAAAGACGACGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCG > 1/1337033‑1337532 | ttCAAAGACGACGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTGTCGGCGTGACGAACTACAACGATGTGACAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTATACGTTCGATCTAAGTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACAGCTCTTTTACATACGATATAAACACCCTATTCCATCCAAACTAACTTGACAGCCCGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑c < 1:596506/251‑1 (MQ=255) tCAAAGACGACGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cc < 1:762845/251‑1 (MQ=255) tttCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctc < 1:810341/251‑1 (MQ=255) tGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctcacctcacc < 1:190963/250‑1 (MQ=255) aTGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAAATACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGGTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctcacctcacctcacctcacct > 1:745851/1‑250 (MQ=255) gAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGGCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTTAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctaacctcacctcacctcacctcacctcccctcac > 1:830240/1‑250 (MQ=255) tATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctc < 1:504125/250‑2 (MQ=255) gaagaaCTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctcaccttgcaca > 1:312171/1‑240 (MQ=255) gaaCTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctcacctcacctcacctcacctaacc > 1:187789/1‑231 (MQ=255) gaaCTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctc > 1:225143/1‑203 (MQ=255) gaaCTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cc > 1:645323/1‑196 (MQ=255) gaaCTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTatat > 1:112496/1‑251 (MQ=255) aCTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCtcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacc < 1:342676/234‑1 (MQ=255) 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cGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCa > 1:304653/1‑251 (MQ=255) gtgAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctc > 1:774846/1‑195 (MQ=255) aGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctcacctcacctcacctcacc > 1:374414/1‑197 (MQ=255) gATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCg > 1:590451/1‑251 (MQ=255) gtTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑cctcacctcacctcacctcacctcacctc < 1:669992/184‑1 (MQ=255) gtTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaactt < 1:751980/213‑16 (MQ=255) 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1:610031/1‑120 (MQ=255) ctctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCaaa > 1:547144/1‑251 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑GCCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCt > 1:401207/1‑250 (MQ=255) ctTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATAT‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTCACCTTGcac < 1:817417/123‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |