| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1918072 = | 80 (0.940) | 8 (0.180) | 7/238 | 3.4 | 13.8% | intergenic (+68696/‑81920) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| ? | 1 | = 1918067 | 58 (1.290) | intergenic (+68691/‑81925) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACC > 1/1917822‑1918322 | aTCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTGATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgt < 1:148197/251‑1 (MQ=255) tCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgtt < 1:825306/251‑1 (MQ=255) tCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgtt < 1:498752/251‑1 (MQ=255) tCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgtt < 1:514121/251‑1 (MQ=255) cGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgtttg > 1:443417/1‑251 (MQ=255) aTCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgtttgtttgtt > 1:324429/1‑251 (MQ=255) tgtgGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttgtttgtttgtttgtttgt > 1:128833/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |