| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 476,998 | T→C | intergenic (‑2832/‑73695) | unknown ← / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 476,998 | 0 | T | C | 100.0% | 484.4 / NA | 141 | intergenic (‑2832/‑73695) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (59/82); total (59/82) | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TGCCTTCCGGCGCCACATCCACATCGTGGAAACAATAATAAGGCACGCCTAATTTGGTGAAAAACTCAAAAGCAATATCCGCTTTTTGTTTTGCCGCCTCTAACGTGCCGGCATTTTTCTGCCAGCTTCGATCCAGCGAACCCAAGCCGAACATATCGGTACCGTTCCAGCAAAACGTATGCCAATAACATACCGCCAAACGCAAATGCTCCGCCATGGTTTTGCCAAGAATGACCTGATTGGTGTCGTAGTATTTATACGCGAAGGGATTGGTTGAGTCAGGACCTTCGTAGCGAACTTTGTCAATGTTGTTGAAGTAGTTTGTCATTGTAGCCTCCGGGACAGGGTTAATTTGGCACTATTCTTGATAAAAGCCCTTTGACGATCAATTACGTTATTTCGCATTGGATTTAAGATTATTGTTTATTGTGGACTGGGTCACAAAAGAGAAAAAACGTAATAGGCTCGGAAGATCTGATAATTGCGTT > 1/476755‑477242 | tGCCTTCCGGCGCCACATCCACATCGTGGAAACAATAATAAGGCACGCCTAATTTGGTGAAAAACTCAAAAGCAATATCCGCTTTTTGTTTTGCCGCCTCTAACGTGCCGGCATTTTTCTGCCAGCTTCGATCCAGCGAACCCAAGCCGAACATATCGGTACCGTTCCAGCAAAACGTATGCCAATAACATACCGCCAAACGCAAATGCTCCGCCATGGTTTTGCCAAGAATGACCTGATTGGCGTCgtag < 1:312695/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |