| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,892,793 | A→G | intergenic (+58352/‑92232) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,892,793 | 0 | A | G | 100.0% | 276.3 / NA | 79 | intergenic (+58352/‑92232) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (40/39); total (40/39) | |||||||||||
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ttACGCAGAAAAACCGGATTTAATGCTGTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATc < 1:488251/251‑1 (MQ=255) cAGAAAAACCGGATTTAATGCTGTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAAt > 1:825845/1‑213 (MQ=255) aGAAAAACCGGATTTAATGCTGTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGACa > 1:101065/1‑251 (MQ=255) 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aaaaaCCGGATTTAATGCTGTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGAc < 1:201193/248‑1 (MQ=255) aaaaaCCGGATTTAATGCTGTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGAc < 1:344988/248‑1 (MQ=255) gATTTAATGCTGTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGACAAAGGCTGGaa > 1:698396/1‑251 (MQ=255) 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1:351102/1‑191 (MQ=255) gTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGAc > 1:845984/1‑229 (MQ=255) gTTAGAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGACAAAGGCTGGAATAAATTAAAg > 1:43796/1‑250 (MQ=255) | TTTACCGCGAAAACAATCGAAGAATGCGCCAAGACAAAGCGCATTTTTTCGTGTTTTCATTTTTGATTTGGGATCGCCGTCGCAAAAATTCACAGGCATTGTTTATCTATAGCGCGCCTTTACCTATGCTCCTTTTTTATTTAAAGGAACTCGTATGCGTCATTTTAAACTGCTTCTCACCCTCTACTTTTTCAGCCTTTTTTGTTACGCAGAAAAACCGGATTTAATGCTGTTAAAAAGCTACAAGAATCAAAATGTGACAGGATGGGTCATGAGCGAAAAATTAGATGGTGTACGCGGTTACTGGGACGGCAAACAAATGTTTACCCGCGGTGGCGTGCAACTGAGTCCGCCTACTTACTTTCTGGAAAAATTCCCGCCTTTTGCCATTGATGGCGAATTATTTAGTCAACGTGATCAATTTGCCGACATTTCTTCTATTGTTCGCGCTTATCAGGACAAAGGCTGGAATAAATTAAAG > 1/1892558‑1893038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |