| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 286,332 | C→T | intergenic (‑18050/+187744) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 286,332 | 0 | C | T | 100.0% | 264.9 / NA | 77 | intergenic (‑18050/+187744) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (44/33); total (44/33) | |||||||||||
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tCCACGTCCTGCGAGTCGATATATTTAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAg > 1:800885/1‑251 (MQ=255) ccACGTCCTGCGAGTCGATATATTTAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGc < 1:427399/251‑1 (MQ=255) ccTGCGAGTCGATATATTTAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAAcc < 1:453757/49‑1 (MQ=255) tCGATATATTTAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGCAATGCTGGAAtt < 1:178828/249‑1 (MQ=255) 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atTTAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGc > 1:193815/1‑230 (MQ=255) atTTAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGT‑AGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCGCCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGCAATGCTGGAATTTGATAAATgg < 1:807972/251‑1 (MQ=255) tttAATGTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGCAATGCTGGAATTTGATAAATgg < 1:428133/251‑1 (MQ=255) 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gTTTACGGTTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGCAATGCTGGAATTTGATAAATGGATGaca > 1:703701/1‑251 (MQ=255) | GAGTTTGCGTGGCTCATGCCGGCAACGTTGCGGGCGAATTCGATTAACGCTACTTGCATTCCCAAACAAATGCCTAAATATGGAATGCTGTTTTCGCGTGCATATTTGGCGGTGAGGATTTTGCCTTCCACGCCACGATAGCCGAAACCGCCCGGTACTAAAATGCCGTCCAAGCCTTTTAAGATTTCAACGCCTTTGGTTTCCACGTCCTGCGAGTCGATATATTTAATGTTTACGGCTAAGCGATTTTTTAAACCTGCGTGTTTTAGGGCTTCGTTCACGGATTTGTAAGCGTCCGGTAATTCGGTGTATTTTCCCACCATGCCGATGATCACTTCGCCCGTCGGGTTAGCTTGTTGATACAACACTTGCTCCCATTCGGACAAATCCGCTTCCGGGCAGGTTAAATGGAAACGATCGCAAATGAAATCGTCCAGCCCTTGAGATTTCAGCAATGCTGGAATTTGATAAATGGATGACA > 1/286094‑286574 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |