| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,540,072 | T→G | intergenic (+207454/+47061) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,540,072 | 0 | T | G | 100.0% | 136.6 / NA | 39 | intergenic (+207454/+47061) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (20/19); total (20/19) | |||||||||||
GTTGTAACTGACATTGCCGGCTTTCGCTAAAGAACGTAACGACCATCCGTTTTTTCGTAACGCCGCTAAAATATCCGCTCGATGCCAATCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATTCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGATGGTTAATT > 1/1539834‑1540315 | gttgtAACTGACATTGCCGGCTTTCGCTAAAGAACGTAACGACCATCCGTTTTTTCGTAACGCCGCTAAAATATCCGCTCGATGCCAATCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCcaac < 1:574045/244‑1 (MQ=255) cTAAAGAACGTAACGACCATCCGTTTTTTCGTAACGCCGCTAAAATATCCGCTCGATGCCAATCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTaa > 1:58762/1‑251 (MQ=255) tAACGACCATCCGTTTTTTCGTAACGCCGCTAAAATATCCGCTCGATGCCAATCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATc < 1:539229/250‑1 (MQ=255) ccgcTAAAATATCCGCTCGATGCCAATCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATg > 1:284322/1‑242 (MQ=255) aTCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGAc < 1:744713/251‑1 (MQ=255) aTCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGAc < 1:466807/251‑1 (MQ=255) gtgCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAgg < 1:295800/241‑1 (MQ=255) gAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAg < 1:388151/240‑1 (MQ=255) aTTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAAt > 1:76559/1‑134 (MQ=255) aTTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAg > 1:351789/1‑235 (MQ=255) cTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATc > 1:243952/1‑162 (MQ=255) cTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTaaa > 1:365917/1‑170 (MQ=255) cTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAg > 1:7803/1‑225 (MQ=255) cATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAGACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCAttt > 1:294612/1‑251 (MQ=255) cATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGc < 1:259565/224‑1 (MQ=255) cATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCAttt > 1:733161/1‑251 (MQ=255) ttAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGt < 1:461089/191‑1 (MQ=255) ttCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAAtt > 1:295091/1‑225 (MQ=255) ccTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAACCGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGCCTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATg > 1:514505/1‑250 (MQ=255) ccTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGAc < 1:486320/199‑1 (MQ=255) ccTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATg > 1:514494/1‑250 (MQ=255) ttttATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAAt < 1:259804/251‑1 (MQ=255) gtgtTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAg < 1:521261/201‑1 (MQ=255) gtTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGt > 1:21614/1‑169 (MQ=255) gTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAgg < 1:734003/175‑1 (MQ=255) gTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAAtt > 1:844234/1‑251 (MQ=255) cTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGct > 1:553429/1‑249 (MQ=255) aaTTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTg < 1:518991/215‑1 (MQ=255) aaCTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGc < 1:514746/251‑1 (MQ=255) tAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACt < 1:863644/251‑1 (MQ=255) atTTTTTATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTaa > 1:501933/1‑251 (MQ=255) tttttATTTACGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAAt < 1:371205/251‑1 (MQ=255) ttatttaCGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAAt < 1:260798/248‑1 (MQ=255) ttatttaCGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGa < 1:536700/251‑1 (MQ=255) atttaCGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAAc > 1:751303/1‑198 (MQ=255) atttaCGCTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGATg < 1:287098/251‑1 (MQ=255) cTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGATGGTTAAtt > 1:410131/1‑251 (MQ=255) cTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGATGGTTAAtt > 1:376883/1‑251 (MQ=255) cTTTTATGCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGATGGTTAAtt > 1:811743/1‑251 (MQ=255) | GTTGTAACTGACATTGCCGGCTTTCGCTAAAGAACGTAACGACCATCCGTTTTTTCGTAACGCCGCTAAAATATCCGCTCGATGCCAATCATGCTGTGCGGTTTTTTTAGAACTATTTAATACACTCATTAACTACATTCCTTTTTATGTGTTTCATGAGCGTATTAAAACGTAAAACTTAATTATAGTCAAGCGTAAAACTTAATTTTTTAAAAATATTTTTTATTTACGCTTTTATTCCAACAAATTCAATTAGTTAAATTAGGTTTTACGGTAAATTTCAATCTTCGTAAAAACGTAAATGTTAGGAGAATTATGTTTTACGCTAACTTTAGGACTTGTATATGAGCAAAGCTAAAATTAATGACCGGGCATTTGCTGAAAGAATGCAATTGCTTTTAAAAACGAAATTCAATGGAAACAGCTCTAAATTTGCCAAAGAAATAGGCATCGCAGTAACTTCTCTAAATAGATGGTTAATT > 1/1539834‑1540315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |