| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,481,392 | A→C | intergenic (+148774/+105741) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,481,392 | 0 | A | C | 100.0% | 200.7 / NA | 59 | intergenic (+148774/+105741) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (30/29); total (30/29) | |||||||||||
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1:21991/251‑1 (MQ=255) aaaCGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaac > 1:882242/1‑241 (MQ=255) aCGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATg < 1:871823/251‑1 (MQ=255) cgcgACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGt < 1:796521/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |