| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,030,472 | A→G | intergenic (‑27338/+22463) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,030,472 | 0 | A | G | 100.0% | 159.3 / NA | 47 | intergenic (‑27338/+22463) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (20/27); total (20/27) | |||||||||||
CAATCTTGGCACCTTCAATCGTATTTGCTAACCAGTTCCAGGTGCCGGTAGTGAATTGTCCGATTCCGGTGGCGCCGGTATGGGAAACATTGCCATACCACCCGTCCTCAATTTTGACCAAACCGCGTAGCATGGCTTCATCTACCTGATAACGGTAAGCGGATTCTTTAATGTAAGTATCAATTTCTGTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGATACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGCATCATCGTCATGACGACTACCGACAACGTAAATATCGACCGGAGTTTTATTATTCACATAAGAGAGAATTCG > 1/1030226‑1030714 | cAATCTTGGCACCTTCAATCGTATTTGCTAACCAGTTCCAGGTGCCGGTAGTGAATTGTCCGATTCCGGTGGCGCCGGTATGGGAAACATTGCCATACCACCCGTCCTCAATTTTGACCAAACCGCGTAGCATGGCTTCATCTACCTGATAACGGTAAGCGGATTCTTTAATGTAAGTATCAATTTCTGTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACt < 1:239564/251‑1 (MQ=255) 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tCAATTTCTGTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATga > 1:799183/1‑251 (MQ=255) gTCCCAAAACCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCg > 1:108021/1‑251 (MQ=255) aaaaCCATTAAAGGCTAAACCCGGAGTAATACAGGCAAAGAGACAGACTATCGGTACTAATAAGCGAGGCGTTGCCATTGACCGTCCTTTTGAATTTGGAATGCGACCGGCATTTTCCCATCACCATATTGCAGCCAGTTGCCGGTATCATGATTTAGGGTAATTAAGCGTTGTTTTACTTTGACCGGATCAATACGATGTTTTTTCGCCCATTGACGAATGGAATCATCGTCATGACGACTACCGACAAc < 1:337839/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |