| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,016,448 | T→C | intergenic (‑13314/+36487) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,016,448 | 0 | T | C | 100.0% | 175.7 / NA | 50 | intergenic (‑13314/+36487) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (25/25); total (25/25) | |||||||||||
TTAATACGGCTGTGCGCCGATGAATTATACAAAATATCCAGTAATGCCGAATCCAGCCATCTGGCTAATTCCCACCAAAATGATGTTGTCACAATGGCAAAGTGCACAAATGTGATCGTAATCACGGTTTTCAACGAATAAGCACTCAAGATAATGATTGCCGGTGTCAGAATGATAACCACCATAATCAAAAATGCCTGTATCATCGGTAATGCTTGGCGTAGTGAATCAAGTCCGGGGAAAATGGTCAGACTGCCCACAAGGGAACCCGCGCCGGCAGCAGTTCTGGCTGCAGCATTTGCCATGGTCGGATCAAGGTTGCCACCGTAACTCGGATAAACTTTTCCTTTGGATACATCGATATTTTCCGGGCGGAGTAGTGTTCTCAGTAGGGCTTCATCTTGATTATCGACCGAGTTAAAAAAGTCACTGACTTGTGCGGAAAGGTTTTGTCGCATATCGGCCAATAAACGTGGTCTTAATCCGGCTT > 1/1016201‑1016690 | ttAATACGGCTGTGCGCCGATGAATTATACAAAATATCCAGTAATGCCGAATCCAGCCATCTGGCTAATTCCCACCAAAATGATGTTGTCACAATGGCAAAGTGCACAAATGTGATCGTAATCACGGTTTTCAACGAATAAGCACTCAAGATAATGATTGCCGGTGTCAGAATGATAACCACCATAATCAAAAATGCCTGTATCATCGGTAATGCTTGGCGTAGTGAATCAAGTCCGGGGAAAATGGCCAg > 1:842646/1‑251 (MQ=255) 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TTAATACGGCTGTGCGCCGATGAATTATACAAAATATCCAGTAATGCCGAATCCAGCCATCTGGCTAATTCCCACCAAAATGATGTTGTCACAATGGCAAAGTGCACAAATGTGATCGTAATCACGGTTTTCAACGAATAAGCACTCAAGATAATGATTGCCGGTGTCAGAATGATAACCACCATAATCAAAAATGCCTGTATCATCGGTAATGCTTGGCGTAGTGAATCAAGTCCGGGGAAAATGGTCAGACTGCCCACAAGGGAACCCGCGCCGGCAGCAGTTCTGGCTGCAGCATTTGCCATGGTCGGATCAAGGTTGCCACCGTAACTCGGATAAACTTTTCCTTTGGATACATCGATATTTTCCGGGCGGAGTAGTGTTCTCAGTAGGGCTTCATCTTGATTATCGACCGAGTTAAAAAAGTCACTGACTTGTGCGGAAAGGTTTTGTCGCATATCGGCCAATAAACGTGGTCTTAATCCGGCTT > 1/1016201‑1016690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |