| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 971,582 | C→T | intergenic (+21333/+31477) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 971,582 | 0 | C | T | 100.0% | 221.4 / NA | 66 | intergenic (+21333/+31477) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (44/22); total (44/22) | |||||||||||
GCGCACGGAGGCAATGAGGGAATTGGTGGTGCCGAGATCAATGCCTACCGCCAGTTTATGTTGATGCGGTGCGGCGCTTTGACCGGGCTCTGCAATTTGAAGTAATGCCATGTTATATCTCGATGTTTTTATTATAAATCAAATAGATTTTCTTCAACCCGTTCAATTTCGGCTTGGAGTTTTTTGATAAAACGTAATTTATCCGTAATCGCCCGCGCCGTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGCGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTAAAATGCGCAGGGCATCATTAATT > 1/971335‑971826 | gcgcACGGAGGCAATGAGGGAATTGGTGGTGCCGAGATCAATGCCTACCGCCAGTTTATGTTGATGCGGTGCGGCGCTTTGACCGGGCTCTGCAATTTGAAGTAATGCCATGTTATATCTCGATGTTTTTATTATAAATCAAATAGATTTTCTTCAACCCGTTCAATTTCGGCTTGGAGTTTTTTGATAAAACGTAATTTATCCGTAATCGCCCGCGCCGTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGa > 1:809288/1‑251 (MQ=255) 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cGCCCGCGCCGTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATgg > 1:391433/1‑251 (MQ=255) ccGCGCCGTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGAt < 1:596231/251‑1 (MQ=255) ccGTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTcc > 1:25950/1‑134 (MQ=255) gTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTaa > 1:688003/1‑251 (MQ=255) ttGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCGGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTaaaa < 1:879601/251‑1 (MQ=255) ttGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTaaaa < 1:88598/251‑1 (MQ=255) gttgttCGTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTtgc > 1:355195/1‑137 (MQ=255) gTTAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTAAAATGCGCAGGGcatcat > 1:601758/1‑251 (MQ=255) ttAAGTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTAAAATGCGCAGGGcatcat < 1:425437/250‑1 (MQ=255) gTGCGGTGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTAAAATGCGCAGGGCATCATTAAtt > 1:572507/1‑251 (MQ=255) | GCGCACGGAGGCAATGAGGGAATTGGTGGTGCCGAGATCAATGCCTACCGCCAGTTTATGTTGATGCGGTGCGGCGCTTTGACCGGGCTCTGCAATTTGAAGTAATGCCATGTTATATCTCGATGTTTTTATTATAAATCAAATAGATTTTCTTCAACCCGTTCAATTTCGGCTTGGAGTTTTTTGATAAAACGTAATTTATCCGTAATCGCCCGCGCCGTTTGCCATTGTTGTTCGTTAAGTGCGGCGGATAATTCCGTTAAAATGGCGCTGCGGGTTTGCTGAATTTCTTGGCTGAAAGCGGTTAATTCGTTGGCATTTTTTTGCTGTTCGATATTTTCCAGGGTTTCCCGCCATTCCATTTGCTGCATCAAAAAGGCAATATCATTGGTGCTTTTTTCTTCTACGTTTTCCGTTTCGCCGGTGTTGATGTCGATAATGCTGTCGGCGCGTGCGATGGGATCTTTTAAAATGCGCAGGGCATCATTAATT > 1/971335‑971826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |