| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 778,077 | C→T | intergenic (+43145/+43800) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 778,077 | 0 | C | T | 100.0% | 174.3 / NA | 52 | intergenic (+43145/+43800) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (26/26); total (26/26) | |||||||||||
CCATAGTCGCGGAAAAACTTCCAGTCACAGTATTACCGACCACGGACGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAATTTAGACTAATAGGAGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATGTGTAATAAGGCGGTGTATTACAACGACCCTTATTTCATCGATAAATTGAAAGCGGTTTCCCCACAACTCCGCGCATTAGGCAAGAAATTACCGACTAAAGCGCAACTGGAAAAAGCCATGTTCAGTGGTGAGCTTTCCGCCCAATCTATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAATTTTTAGTTATGAATACGTTAATCCCTGTTTGCTTTTTAAGCGCGTGCAGCTCGTCAACGCCGGAACCGCCACAAATCGATGAAGACGCCCCGGCAATTTATTTAAATAATCAGGTGTACCGACAAACACCAACTGCAACAGTGCCAAAAAACG > 1/777831‑778309 | ccATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGt < 1:94956/251‑1 (MQ=255)ccATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGt > 1:653968/1‑251 (MQ=255) cgaggtaaaaCATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAgtgg < 1:769097/245‑1 (MQ=255) cgaggtaaaaCATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAgtgg < 1:330234/245‑1 (MQ=255) 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> 1:412919/2‑251 (MQ=255) taataaGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAatat > 1:98836/1‑186 (MQ=255) taataaGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAAATTTTACTTATGAATATGTTAAtacc < 1:757953/219‑4 (MQ=255) taataaGGCAGTGTATTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAAATTTTACTTATGAATATGTTAATACCTGTTTGCTTTTTAAGCGCGTGCAGCTCGTCa > 1:565257/1‑250 (MQ=255) 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1:686158/172‑1 (MQ=255) aTTACAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAAATTTTACTTATGAATATGtt < 1:467659/199‑1 (MQ=255) cAACGATCCTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAatat > 1:766284/1‑168 (MQ=255) gatccTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAAcc > 1:326548/4‑151 (MQ=255) atccTTATTTTATAGACAAACTCAAAGCGGTATCTCCGCAATTGCGAGCATTAGGTAAAAAATTACCGACAAAAGAACAATTGGAAAAAGCTATGTTCAGTGGCGAGCTGTCAGTCCAATCAATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAAATTTTACTTATGAATATGTTAAtacc < 1:777520/194‑4 (MQ=255) 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CCATAGTCGCGGAAAAACTTCCAGTCACAGTATTACCGACCACGGACGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAATTTAGACTAATAGGAGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATGTGTAATAAGGCGGTGTATTACAACGACCCTTATTTCATCGATAAATTGAAAGCGGTTTCCCCACAACTCCGCGCATTAGGCAAGAAATTACCGACTAAAGCGCAACTGGAAAAAGCCATGTTCAGTGGTGAGCTTTCCGCCCAATCTATTTAATCCACAAAAACTGTGAATAACCAGGAGGATAATATGAAAAAATTTTTAGTTATGAATACGTTAATCCCTGTTTGCTTTTTAAGCGCGTGCAGCTCGTCAACGCCGGAACCGCCACAAATCGATGAAGACGCCCCGGCAATTTATTTAAATAATCAGGTGTACCGACAAACACCAACTGCAACAGTGCCAAAAAACG > 1/777831‑778309 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |