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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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atATGCACCCGACAACCAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGat > 1:677598/2‑151 (MQ=255) atATGCACCCGACAACCAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATatgt < 1:894996/207‑1 (MQ=255) ccAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTAc > 1:79394/2‑211 (MQ=255) | AAATATCAGTTATTACTACTCATGGATGAGTTTACTGCGGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGCTATGGTTTACGCCTATTGATTATCTATCAATCACAAGGGCAACTTCGTGCCGATAAGCCTAATGGTTACGGTAAAGATGGTGCTAAAGCTATCCTGGATAATATTGCCTGTAAAATTCTGTATGCTCCCGACAATCAGGAGGATGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAGATAAATTAAGCCATAGTCGCGGAAAAACTTCCAGTCACAGTATTACCGACCACGGACGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAATTTAGACTAATAGGAGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATGTGTAATAAGGCGGTGTATTACAACGACCCTTATTTCATCGA > 1/777550‑778001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |