| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 680,739 | A→G | intergenic (+62382/‑15844) | unknown → / → unknown | tRNA‑Arg‑ACG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 680,739 | 0 | A | G | 100.0% | 293.1 / NA | 83 | intergenic (+62382/‑15844) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑ACG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (39/44); total (39/44) | |||||||||||
GCTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCACATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAATCTCCTCCCCCTTCGGACCGGTCA > 1/680499‑680979 | gCTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAgg < 1:184068/250‑1 (MQ=255) cTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGtt < 1:20129/251‑1 (MQ=255) ccGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGcc < 1:316941/250‑1 (MQ=255) aaCTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTa > 1:327326/1‑251 (MQ=255) cTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATc < 1:842059/251‑1 (MQ=255) ccTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCggg > 1:561185/1‑251 (MQ=255) gtgATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGt > 1:113769/1‑251 (MQ=255) cacaTTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCgg > 1:327048/1‑203 (MQ=255) caTTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGtt > 1:258555/1‑194 (MQ=255) tGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgac < 1:181655/249‑1 (MQ=255) ggCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAgg < 1:340274/185‑1 (MQ=255) gTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgac > 1:757421/1‑242 (MQ=255) tCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAg < 1:272220/222‑1 (MQ=255) tCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAgg > 1:894737/1‑251 (MQ=255) gCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCAt > 1:28400/1‑165 (MQ=255) gCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCt < 1:829642/228‑1 (MQ=255) gCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGc > 1:326700/1‑250 (MQ=255) gCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGc > 1:832994/1‑250 (MQ=255) ggTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAgg > 1:62959/1‑237 (MQ=255) tATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATcccc < 1:854990/251‑1 (MQ=255) ttCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCa > 1:140341/1‑251 (MQ=255) atatCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAg > 1:507360/1‑201 (MQ=255) atatCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGcc < 1:239603/251‑1 (MQ=255) cGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc < 1:210107/251‑1 (MQ=255) gAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc < 1:565825/247‑1 (MQ=255) gCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgac < 1:599576/208‑1 (MQ=255) tGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAgg < 1:631067/251‑1 (MQ=255) tCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGt > 1:663267/1‑251 (MQ=255) cGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGCCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTTGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCg > 1:481975/1‑251 (MQ=255) ttgttTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgac > 1:720505/1‑191 (MQ=255) ttgttTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGATCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCg > 1:690883/1‑249 (MQ=255) tgttTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCAt < 1:638674/121‑1 (MQ=255) gttTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGt < 1:434031/156‑1 (MQ=255) tttACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCAcc < 1:869343/250‑1 (MQ=255) cTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAAc < 1:824961/251‑1 (MQ=255) tCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgac > 1:254072/1‑175 (MQ=255) cTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc > 1:234332/1‑211 (MQ=255) cTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTgg > 1:134474/1‑251 (MQ=255) ttCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGt < 1:708415/140‑1 (MQ=255) atcatcatcCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGtcatc < 1:562406/251‑1 (MQ=255) ccATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCATATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGCCGCCTTCTAAAAAGTCTACCCTCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACACGAACTGTGGTCATCCTACTTGc > 1:874953/1‑250 (MQ=255) ccATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTGTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGcc < 1:706931/251‑1 (MQ=255) cATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATccccc < 1:78216/186‑1 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCAt > 1:293027/1‑147 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATc < 1:79859/148‑1 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc > 1:481972/1‑195 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc < 1:241327/195‑1 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGt < 1:403942/210‑1 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGtcatc < 1:693467/240‑1 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCtt > 1:263142/1‑251 (MQ=255) aTTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCtt > 1:620228/1‑251 (MQ=255) ttATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGtcatc > 1:757945/1‑239 (MQ=255) accaccGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgaccgacc < 1:105922/157‑1 (MQ=255) accaccGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGACGCCTTCTAAAAAGACTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCCCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCCCCCAAGGGTGGGTTACCCCCACCCAACAAGAACAGTGGTCATCATACTTGCCTTcc > 1:600732/1‑247 (MQ=255) cccTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc > 1:484226/1‑182 (MQ=255) cccTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATaa > 1:752330/1‑251 (MQ=255) ccTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAg > 1:17682/1‑251 (MQ=255) ccTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGCCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAg > 1:545665/1‑251 (MQ=255) ccTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCGGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGGAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCCCCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCAACCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAg < 1:385705/251‑1 (MQ=255) cTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTAcc > 1:572274/1‑180 (MQ=255) ttATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGt < 1:284269/194‑1 (MQ=255) ttATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACtg < 1:136012/216‑1 (MQ=255) ttATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGaa < 1:512619/251‑1 (MQ=255) taGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTg < 1:121572/251‑1 (MQ=255) gTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGccacc > 1:544293/1‑156 (MQ=255) gTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTgg < 1:847636/213‑1 (MQ=255) gTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTaa > 1:64964/1‑251 (MQ=255) gTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTaa > 1:828670/1‑251 (MQ=255) aCATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCAc < 1:756213/250‑1 (MQ=255) cATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATgaccgacc < 1:63416/124‑1 (MQ=255) cATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGtcatc < 1:568200/201‑1 (MQ=255) gggTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGt < 1:366646/246‑1 (MQ=255) gggTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCg > 1:821994/1‑251 (MQ=255) ttgtGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAAt > 1:154272/1‑249 (MQ=255) tgGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAAc < 1:265269/217‑1 (MQ=255) gCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCCCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAATCTCCTCCCCCTTCGGAcc < 1:446031/250‑1 (MQ=255) cGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAATCTCCTCCCCCTTCGGACCGGTca > 1:781024/1‑251 (MQ=255) ggCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGTTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTc < 1:452092/208‑1 (MQ=255) ggCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAg < 1:709342/63‑1 (MQ=255) gCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGt > 1:613048/1‑48 (MQ=255) gCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGtca < 1:191098/161‑1 (MQ=255) gCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTcc < 1:351686/182‑1 (MQ=255) atTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTccc < 1:345460/173‑1 (MQ=255) | GCTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCACATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAATCTCCTCCCCCTTCGGACCGGTCA > 1/680499‑680979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |