| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 610,281 | T→C | intergenic (+57761/‑7889) | unknown → / → unknown | tRNA‑Ala‑TGC/tRNA‑Ser‑GCT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 610,281 | 0 | T | C | 100.0% | 294.3 / NA | 83 | intergenic (+57761/‑7889) | unknown/unknown | tRNA‑Ala‑TGC/tRNA‑Ser‑GCT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (46/37); total (46/37) | |||||||||||
GATGTTAAATTTTATGATGAAATTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCTTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGATCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTCAAAGTTTACAAAAGATGAAAAG > 1/610054‑610523 | gATGTTAAATTTTATGATGAAATTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATACTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAAt < 1:619082/249‑1 (MQ=255) atgaAATTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTtgtg < 1:96143/251‑1 (MQ=255) aaTTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAAcc < 1:229692/237‑1 (MQ=255) aaTTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATgg > 1:699975/1‑251 (MQ=255) aaTTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATgg > 1:697763/1‑251 (MQ=255) aaTTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATgg > 1:37517/1‑251 (MQ=255) gCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTggg > 1:397481/1‑250 (MQ=255) aTTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATCGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAAt < 1:781796/199‑1 (MQ=255) tAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTc > 1:511342/1‑235 (MQ=255) ggTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCg < 1:620500/247‑1 (MQ=255) gtgtTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAg > 1:320996/1‑210 (MQ=255) ttATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATg > 1:269377/1‑174 (MQ=255) aTCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACAGTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTc < 1:25203/209‑1 (MQ=255) cTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTCATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAAt > 1:750218/1‑236 (MQ=255) tttCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATTACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGaccg > 1:203615/1‑246 (MQ=255) gTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATAGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGaaaa > 1:451869/1‑251 (MQ=255) gAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCca > 1:666020/1‑250 (MQ=255) tAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTa > 1:355041/1‑251 (MQ=255) tAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTa > 1:765079/1‑251 (MQ=255) ttGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg < 1:284912/251‑1 (MQ=255) ttGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg < 1:499897/251‑1 (MQ=255) ttGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg < 1:90405/251‑1 (MQ=255) cAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGcac < 1:12911/251‑1 (MQ=255) aaGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATg < 1:488105/234‑1 (MQ=255) aaGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg > 1:897186/1‑242 (MQ=255) aaGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACaaat > 1:898561/1‑251 (MQ=255) atattgatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTaa > 1:332607/1‑231 (MQ=255) atattgatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg > 1:326145/1‑233 (MQ=255) atattgatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGAAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGAATATGAATATCCCTTAGAATTTaaa > 1:473703/1‑104 (MQ=255) tgatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTa > 1:811765/1‑251 (MQ=255) gatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg > 1:148958/1‑228 (MQ=255) gatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTaa > 1:514369/1‑251 (MQ=255) gatattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTaa > 1:82873/1‑251 (MQ=255) atattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTc > 1:389068/1‑145 (MQ=255) atattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAAc < 1:169549/211‑1 (MQ=255) atattATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg > 1:305527/1‑227 (MQ=255) tattatTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTaaaa > 1:114456/1‑251 (MQ=255) ttattGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAAc < 1:751598/251‑1 (MQ=255) ttattGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAAc < 1:249939/251‑1 (MQ=255) ttGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCt > 1:559475/1‑128 (MQ=255) gTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAACAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGa > 1:431566/1‑251 (MQ=255) aTTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTg < 1:148319/250‑1 (MQ=255) cacTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGa > 1:561502/1‑251 (MQ=255) cTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTc > 1:641917/1‑120 (MQ=255) cTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGaccg < 1:837383/167‑4 (MQ=255) cTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg < 1:538654/202‑1 (MQ=255) cTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAAc < 1:357802/251‑1 (MQ=255) aTTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTaaa < 1:853856/71‑1 (MQ=255) aTTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCGCATGTATTAATGAGCACaaata < 1:521177/210‑1 (MQ=255) aTTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTAtt < 1:882805/196‑1 (MQ=255) aTTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg > 1:672017/1‑200 (MQ=255) aTTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACtt > 1:853546/1‑251 (MQ=255) tataTGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGt < 1:280191/251‑1 (MQ=255) tataTGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGt < 1:513875/251‑1 (MQ=255) atatGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTaaa < 1:865207/67‑1 (MQ=255) tatGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTgg < 1:322995/251‑1 (MQ=255) gTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTg > 1:582652/1‑81 (MQ=255) gTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTa > 1:203256/1‑185 (MQ=255) gTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTaa < 1:503460/229‑1 (MQ=255) gTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGagaa > 1:550831/1‑251 (MQ=255) gACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg > 1:863458/1‑186 (MQ=255) cGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGt > 1:269715/1‑250 (MQ=255) aaTTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGcc > 1:446463/1‑48 (MQ=255) gtggtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTcc > 1:84267/1‑78 (MQ=255) gtggtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTaa < 1:637732/157‑1 (MQ=255) ggtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAAc < 1:105194/184‑1 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATg > 1:410551/1‑148 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg < 1:652530/156‑1 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAAc > 1:884111/1‑183 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTg > 1:336398/1‑197 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGc < 1:494827/230‑1 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGc < 1:519436/230‑1 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTCAAAGTTTACAAAAGAt > 1:273570/1‑251 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTCAAAGTTTACAAAAGAt > 1:140002/1‑251 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTCAAAGTTTACAAAAGAt > 1:52087/1‑251 (MQ=255) gtATATGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTAGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGgaga < 1:230482/215‑1 (MQ=255) tataTGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACaaat < 1:700546/164‑1 (MQ=255) atatGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGt < 1:33904/208‑1 (MQ=255) atGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTaa < 1:206504/190‑1 (MQ=255) tGAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTc > 1:836787/1‑230 (MQ=255) gAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATg < 1:57313/150‑1 (MQ=255) gAATATCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTCAAAGTTTACAAAAGATGAAAAg > 1:346325/1‑251 (MQ=255) atatCCCTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGACCGCTTCCATaa < 1:898117/122‑1 (MQ=255) | GATGTTAAATTTTATGATGAAATTGCAACAGCCCAAATTATGGCGAATGCTTTAAAAGCACAGGGTGTTAACAAAATTATCTTACTTTCCCATGCGGGCAGTGAAAAGAACATAGAAATTGCGCAAAAAGTAAATGATATTGATATTATTGTTACCGGCGATTCACACTATTTATATGGTAATGACGAGTTGCGTGAATTGAAATTGCCGGTGGTATATGAATATCCTTTAGAATTTAAAAGCCCGAATGGTGAACCTGTTTTTGTGATGGAAGCTTGGGCTTATTCCGCCGTAGTGGGCGATTTAGGCGTTAAATTCAGCAAAGATGGGATCGCTTCCATAATCCGAAAAACTCCACATGTATTAATGAGCACAAATAAATTAAAAGTTAAAAACAGTGACGGTAATTGGCAGGAACTTAGTGGAGAAGAACGTCAAAAAGCAATTCAAAGTTTACAAAAGATGAAAAG > 1/610054‑610523 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |