| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1606258–1606336 | 1611635–1606340 | 5–5378 | 23 [22] | [20] 26 | unknown–unknown | unknown,unknown,unknown |
GCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTGAGATCATTTTTGTGCAAAACACTTGATTATTTGTTTGAT > 1/1611432‑1611886 | gCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGtattat > 1:316144/1‑249 (MQ=14) ttCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCt < 1:774938/251‑1 (MQ=14) ttCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCt < 1:602776/251‑1 (MQ=14) cAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCaa < 1:602237/251‑1 (MQ=14) cTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCtt > 1:469808/1‑251 (MQ=39) aaataatataaataaACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAAttt > 1:884834/1‑250 (MQ=255) aaTCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTAt < 1:584858/250‑1 (MQ=255) ttCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGc > 1:107327/1‑137 (MQ=18) ttCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTAttttt < 1:269801/218‑1 (MQ=255) aTTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACg > 1:853540/1‑251 (MQ=255) tCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCaa > 1:854061/1‑251 (MQ=255) cattTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTAC‑TTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTTTTTTTTGTCAAATTTTTTTTCAAACCTTAATATTGACATTTAATAAACGCAGCGTTTTCAATCCtttct > 1:899665/2‑246 (MQ=17) gTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCaaa < 1:406529/185‑1 (MQ=255) gTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGAc < 1:310525/233‑1 (MQ=255) gTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAAt > 1:453314/1‑243 (MQ=255) gTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTaaa > 1:753411/1‑251 (MQ=255) caGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTc > 1:855484/1‑250 (MQ=255) gTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGc < 1:147215/90‑1 (MQ=35) gTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAAc < 1:877773/199‑1 (MQ=255) aCAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGAc > 1:819327/1‑198 (MQ=255) gTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTAcc < 1:462608/62‑1 (MQ=37) gTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCt > 1:269226/1‑151 (MQ=255) gTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAGATCCTAAAg > 1:454733/1‑179 (MQ=255) gTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTg > 1:350211/1‑212 (MQ=255) gTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTGAGATCAtt < 1:155098/220‑1 (MQ=255) gTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTGAGATCATTTTTGTGCAAAACACTTGATTATTTGTTTGAt > 1:409307/1‑251 (MQ=255) | GCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTGAGATCATTTTTGTGCAAAACACTTGATTATTTGTTTGAT > 1/1611432‑1611886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |