| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 79,058 | (GAAGCCA)4→2 | intergenic (–/+54870) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 79042 | 79055 | 14 | 51 [0] | [0] 51 | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 79056 = | 0 (0.000) | 47 (0.580) | 34/398 | 1.1 | 100% | intergenic (–/+54885) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| ? | 1 | = 79041 | 0 (0.000) | intergenic (–/+54900) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC | |||||
AAATACAGGCGTTACAAAAAATGGTCACCGAACTGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAACTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATC > 1/78795‑79283 | aaaTACAGGCGTTACAAAAAATGGTCACCGAACTGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCATGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGcaga < 1:132309‑M2/251‑5 (MQ=255) 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1:260542‑M2/1‑9 (MQ=255) aTTTTATGcagaagccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatcccctttatcttgac < 1:367683‑M2/250‑243 (MQ=255) aTTTTATGcagaagccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatcccctttatcttgac < 1:89832‑M2/250‑243 (MQ=255) aTTTTATGcagaagccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatc > 1:249690‑M2/1‑8 (MQ=255) aTTTTATGcagaagccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattg < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |