| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,420,822 | (TGCCT)6→5 | intergenic (+88204/+166307) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1420795 | 1420799 | 5 | 40 [0] | [0] 40 | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1420800 = | 0 (0.000) | 36 (0.470) | 30/376 | 1.3 | 100% | intergenic (+88182/+166333) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | = 1420794 | 0 (0.000) | intergenic (+88176/+166339) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAAC > 1/1420556‑1421039 | ttCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCATTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgcct > 1:483973‑M2/1‑239 (MQ=255) 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(MQ=255) ggAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaact > 1:885899‑M2/1‑15 (MQ=255) aaaaTATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaac > 1:870213‑M2/1‑8 (MQ=255) aaTATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagcc > 1:305433‑M2/1‑6 (MQ=255) | TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAAC > 1/1420556‑1421039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |