| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | = 618330 | 33 (0.380) | noncoding (50/77 nt) | unknown | tRNA‑Arg‑ACG | |||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CGGAAAATAAAGGACAAAAACCCCGTTCGGATTTGTTGAGAAATCGCTCAACCAAGTTGATTTCAGGCACTTTTCGGAAAAAATAATTTGACTTATTGTCATAAACCCGTATCATACCGCCCACAAATCGATTGTGGTGAGATGGCCGAGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAATATCTAACGGAAT > 1/618035‑618527 | ttgtggtgagatggccgagcaggctgaaggcgctcccctgctaagggagtatggggtcaaaaactccatcgagggttcgaacccctctctcaccgccatttgtttaatttgtctcgcacccgtagctcagctggatagagtactcggctacgaaccgagcggtcagaggttcgaatcctctcgggtgcgccattttaagtcgactctatggtttaaaatggtttgagcgagttaaacattcactaCGCAcc > 1:454441‑M1/246‑251 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(MQ=255) gCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAgaggttcgaatcctctcgggtgcgccattttaagtcgactctatggtttaaaatggtttgagcgagttaaacattcactacgcacccgtagctcagctggatagagtactcggctacgaaccgagcggtcaaaggttcgaatcctttcgggtgcgccatttcacattccaacaatttct < 1:431‑M2/250‑180 (MQ=255) agttaaacattcactaCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGc < 1:845839‑M1/177‑1 (MQ=255) gttaaacattcactaCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAat < 1:672888‑M1/236‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |