| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1087852 = | NA (NA) | 293 (3.580) | 118/402 | 0.0 | NA | intergenic (+89/+22455) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Gly‑GCC |
| ? | 1 | = 1087863 | NA (NA) | intergenic (+100/+22444) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Gly‑GCC | |||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
TTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1088113‑1087852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctctttctctttCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCTTGGCAAGTTTCGTGCTTAGATGC < 1/1087863‑1087614 CTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC < 1:121382/251‑1 TCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC < 1:608141/251‑1 TCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC < 1:533434/251‑1 TCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC < 1:755112/251‑1 GTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTT > 1:745808/1‑251 TATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTC < 1:859122/251‑1 TGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC < 1:673018/251‑1 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1:368855/1‑229 TCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGC > 1:764782/1‑232 CTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTCTTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGC > 1:430137/1‑231 CTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAG > 1:100844/1‑251 CTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAG < 1:405816/251‑1 CTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGC > 1:882433/1‑231 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATAT > 1:375482/1‑251 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATAT > 1:65691/1‑251 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATAT > 1:112480/1‑251 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATAT > 1:505691/1‑251 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTC < 1:145720/244‑1 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCT < 1:195422/212‑1 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCC < 1:717111/182‑1 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATAC < 1:93150/145‑1 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATAC > 1:240884/1‑145 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCT > 1:557085/1‑140 CTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC < 1:561851/115‑1 ATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCA > 1:63757/1‑251 ATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCA > 1:226435/1‑251 ATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTC > 1:529515/1‑242 ATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATAC < 1:410831/143‑1 ATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATC > 1:484252/1‑119 TACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCAC < 1:17750/251‑1 CTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCC < 1:270971/204‑1 TCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCCCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACAC < 1:450553/251‑1 CAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACAC < 1:557936/251‑1 CAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACAC < 1:543143/251‑1 CCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTAT > 1:819204/1‑250 AACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGT < 1:162540/251‑1 AACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGT < 1:593229/251‑1 AACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCC < 1:516346/151‑1 ACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTC < 1:295886/251‑1 TCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCT < 1:299225/251‑1 CTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTA > 1:514227/1‑192 CCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAA > 1:799702/1‑250 CTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTT > 1:107268/1‑251 CTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGC < 1:378714/160‑1 CTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCC > 1:587055/1‑131 CTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATAC < 1:370984/94‑1 CTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAG < 1:347482/251‑1 CTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGC < 1:468805/154‑1 CTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTC > 1:38687/1‑58 ATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGC > 1:538043/1‑189 TCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTC < 1:550542/251‑1 CTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCTTGGCAAG < 1:487061/240‑1 TCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGTAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCTTGGCAAGTTTCGTGCTTAGATGC < 1:445778/251‑1 TTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1088113‑1087852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctctttctctttCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCTTGGCAAGTTTCGTGCTTAGATGC < 1/1087863‑1087614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |