| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,243,925 | Δ1 bp | intergenic (‑133543/‑62640) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,243,924 | 0 | A | . | 100.0% | 189.7 / NA | 43 | intergenic (‑133542/‑62641) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (22/21); total (22/21) | |||||||||||
ATTACTGCATGAATCTGTTGCGGACTTATATTCTGTGTAATGTCTTCTTTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATATTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTAATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATACAGTGATACTTTTATCTTAGCGAAAAGTACTCGTGCTACTAATGACAGTTTTTATCTTTATAAAATGAATATTAATTTTTTATGTCGTGTCAGAGTGGTTAATACACATAATGCTTTAATACAACC > 1/1243681‑1244162 | aTTACTGCATGAATCTGTTGCGGACTTATATTCTGTGTAATGTCTTCTTTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATACTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCT‑ATTGTTAt < 1:43700/251‑1 (MQ=255) 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tgtgATGTTGGCTACCT‑ATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATACAGTGACACTTTTATCTTAGCGAAAAGTACTCGTGCTACTAATGACAGTTTTTATCTTTATAAAATGAATATTAATTTTTTATGTCGTGTCAGAGTGGTTAATACACATAATGCTTTAATAc < 1:380727/251‑1 (MQ=255) aTGTTGGCTACCT‑ATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATACAGTGACACTTTTATc > 1:612875/1‑141 (MQ=255) aTGTTGGCTACCT‑ATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATACAGTGACACTTTTATc > 1:414002/1‑141 (MQ=255) aTGTTGGCTACCT‑ATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATACAGTGACACTTTTATCTTAGCGAAAAGTACTCGTGCTACTAATGACAGTTTTTATCTTTATAAAATGAATATTAATTTTTTATGTCGTGTCAGAGTGGTTAATACACATAATGCTTTAATACAAcc < 1:770298/251‑1 (MQ=255) 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ATTACTGCATGAATCTGTTGCGGACTTATATTCTGTGTAATGTCTTCTTTATTCCGGTTATTCTTGGTTACATCCTGACAGTTGGAAAAGTTAATTATCTTTTCGCAATCTTCTATATTGGCATTACTTTTATCTTTACTCTTTTGTTTAAAAATTATATTCACAAGCACATCGGTACGATTTCTATCAACACGACTATCGCGTTTTTATATAAAAATAAAATTTATGTGATGTTGGCTACCTAATTGTTATTTTGTAATATGTGCGTTTATCGTCGGATATTCCCGCCCACATTTCAAAACAGTATTTGACTCATTAGAAATTGAAGGCAAAGCCTATTACGTATTAGCAAAATACAGTGATACTTTTATCTTAGCGAAAAGTACTCGTGCTACTAATGACAGTTTTTATCTTTATAAAATGAATATTAATTTTTTATGTCGTGTCAGAGTGGTTAATACACATAATGCTTTAATACAACC > 1/1243681‑1244162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |