| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,105,200 | A→G | intergenic (‑232/‑9) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/Membrane‑bound lytic murein transglycosylase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,105,200 | 0 | A | G | 100.0% | 246.2 / NA | 71 | intergenic (‑232/‑9) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/Membrane‑bound lytic murein transglycosylase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (38/33); total (38/33) | |||||||||||
GCTCCACCCCGCGTTAGAGGGCGCTAACTATACCCGTTTGAAAATGAATTGCAAGTTTAAATGTAAAAATAATGTTTATTTGTTACAAAAATAAACGATATGCCGTTTTTTTCAACAAAATACTTCTTCCCAAAAACATTGTTTTTTATGACCGCACTTTTATGGCGTTCAACGTGAATTTCATATTCATCCGCTACAAATTGGTGTAAAATTCACCCTTTGTGTTTTACCCATTTTACTTTTAAGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATCAGGGTGA > 1/2104956‑2105444 | gctCCACCCCGCGTTAGAGGGCGCTAACTATACCCGTTTGAAAATGAATTGCAAGTTTAAATGTAAAAATAATGTTTATTTGTTACAAAAATAAACGATATGCCGTTTTTTTCAACAAAATACTTCTTCCCAAAAACATTGTTTTTTATGACCGCACTTTTATGGCGTTCAACGTGAATTTCATATTCATCCGCTACAAATTGGTGTAAAATTCACCCTTTGTGTTTTACCCATTTTACTTTTAGGACGtt > 1:558540/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gtTTTACCCATTTTACTTTTAGGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCggt > 1:699308/1‑251 (MQ=255) aTTTTACTTTTAGGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATAc > 1:22707/1‑140 (MQ=255) aTTTTACTTTTAGGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACAt > 1:682988/1‑149 (MQ=255) aTTTTACTTTTAGGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATc > 1:373530/1‑250 (MQ=255) cTTTTAGGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTg < 1:276479/220‑1 (MQ=255) cTTTTAGGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATCAGGGTGa > 1:788559/1‑251 (MQ=255) | GCTCCACCCCGCGTTAGAGGGCGCTAACTATACCCGTTTGAAAATGAATTGCAAGTTTAAATGTAAAAATAATGTTTATTTGTTACAAAAATAAACGATATGCCGTTTTTTTCAACAAAATACTTCTTCCCAAAAACATTGTTTTTTATGACCGCACTTTTATGGCGTTCAACGTGAATTTCATATTCATCCGCTACAAATTGGTGTAAAATTCACCCTTTGTGTTTTACCCATTTTACTTTTAAGACGTTATATGCTATTCAACCGCACTTCTTTTTATAAATTTCTCACGCTTTCCGCTATTGCGGTATTAACGGCATGTTCCTCCAATTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATCAGGGTGA > 1/2104956‑2105444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |