| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,024,332 | T→G | intergenic (‑125/+285) | unknown ← / ← unknown | PTS system, mannitol‑specific IIC component / PTS system, mannitol‑specific IIB component (EC 2.7.1.197) / PTS system, mannitol‑specific IIA component (EC 2.7.1.197)/RTX toxin transporter, determinant D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,024,332 | 0 | T | G | 100.0% | 184.1 / NA | 53 | intergenic (‑125/+285) | unknown/unknown | PTS system, mannitol‑specific IIC component / PTS system, mannitol‑specific IIB component (EC 2.7.1.197) / PTS system, mannitol‑specific IIA component (EC 2.7.1.197)/RTX toxin transporter, determinant D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (25/28); total (25/28) | |||||||||||
GAATAAATAACGCCGTAATAAAACCCCAGGCAATAAACGCGCCGATATTCGGCATCACCATATTAGACAAAAAGCGTCCGAAGCTTTGAATCTTCACTTTTGCACTTGCTGATAACATAATTGTCTCCGTCACAGGTTTAAAGTGCGGTCAAAATAGCACAAGAAAATTTTTGTCAAAAACTTTTTTCGGAAAAAATGTGAACTACATCACAATATTTTTTAACCAAAAATTTTTAAAACGTTATACAGATCACAGTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCGGGGAAATCCACCGCACTTTTGCACCAGAAAACTACAACGGGCTTTCGGCTTGCTGGTATTCGCAAATGCAGGTAATACGATTTCAATTATAAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCAAATCCATTTTCAATTTAGACTTTTGATACA > 1/2024090‑2024578 | gAATAAATAACGCCGTAATAAAACCCCAGGCAATAAACGCGCCGATATTCGGCATCACCATATTAGACAAAAAGCGTCCGAAGCTTTGAATCTTCACTTTTGCACTTGCTGATAACATAATTGTCTCCGTCACAGGTTTAAAGTGCGGTCAAAATAGCACAAGAAAATTTTTGTCAAAAACTTTTTTCGGAAAAAATGTGAACTACATCACAATATTTTTTAACCAAAAATTTTTAAAACGTGATACAg > 1:876359/1‑249 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |