| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,697,627 | T→C | R249R (CGT→CGC) | unknown → | Sulfate transporter, CysZ‑type |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,697,627 | 0 | T | C | 100.0% | 228.4 / NA | 69 | R249R (CGT→CGC) | unknown | Sulfate transporter, CysZ‑type |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (23/46); total (23/46) | |||||||||||
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tgGGTAACGGAATACCGTGCTTTATTTAAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTCAAACTAACGCCACTTCATTATTTATCCTCAGGAGAACATATTATGACTATTTACAGTGACAATTCTTATTCTATCGGCAAt < 1:113009/250‑1 (MQ=255) gggTAACGGAATACCGTGCTTTATTTAAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATg > 1:509274/1‑124 (MQ=255) ggTAACGGAATACCGTGGTTTATTTAAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCATTATTTATCCTCAGGAGAACATATTATGACTATTTACAGTGACAATTCTTATTCTATCGGCAATAc < 1:747434/250‑1 (MQ=255) aCGGAATACCGTGCTTTATTTAAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCattat < 1:334369/184‑1 (MQ=255) gAATACCGTGCTTTATTTAAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCATTATTTATCCTCAGGAGAACATATTATGACTATTTACAg < 1:901312/216‑1 (MQ=255) tACCGTGCTTTATTTAAGCGCTCGCAACAAGCGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGCATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCATTATTTATCCTCAGGAGAACATATTATGACTATTTACAGTGACAATTCTTATTCTATCGGCAATACCCCGTTAGTAc < 1:252353/251‑1 (MQ=255) ttatttaAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCATTATTTATTCTCAGGAGAACATATTATGACTATTTACAGTGACAATTCTTATTCTATCGGCAATACCCCGt < 1:348332/236‑1 (MQ=255) atttaAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTc > 1:861286/1‑79 (MQ=255) atttaAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTTTTGCTTAAAATAAAGCCACCTCATTATTTTTTTTCTGGAGAACATAATATTAATATTTACAGTGACAAATCTTTTTTTTTTTGCAACACCCCCCTAGTACGTTTaaaaaaa > 1:838676/1‑248 (MQ=255) atttaAGCGCTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCATTATTTATCCTCAGGAGAACAtatt < 1:656674/188‑1 (MQ=255) | ACCTTTTTATTCACCGCATGGATGATGGCGATTCAATATTGCGACTATCCTTTTGATAACCACAAAATCCCTTTCGGCATAATGAAAAACGAACTGGCGATTAAGCGCAATGTGACGATGACCTTCGGCAGTTTGGTGACGCTTTGTACTTTTGTGCCAGTGGTGAATCTGGTGATTATTCCCGTGGCAGTGTGTGGCGCAACGGCAATGTGGGTAACGGAATACCGTGCTTTATTTAAGCGTTCGCAACAAGGGCAAACCGGCACTGAAGTGAATGTGAATCGTCGCTCTTCCGGCGACGGTGTTATCGTCAGAAAATAGCTTTTGGTTATATGATTTATAAAAAATAGCTATTGTTTTATCGGCGGTTCTCATGCTAAAACTAACGCCACTTCATTATTTATCCTCAGGAGAACATATTATGACTATTTACAGTGACAATTCTTATTCTATCGGCAATACCCCGTTAGTACGTTTAAAACAT > 1/1697385‑1697868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |