| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,467,233 | C→T | intergenic (+121/‑47) | unknown → / → unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,467,233 | 0 | C | T | 100.0% | 204.2 / NA | 60 | intergenic (+121/‑47) | unknown/unknown | Murein‑DD‑endopeptidase (EC 3.4.99.‑)/Chromosome partition protein MukF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/23); total (37/23) | |||||||||||
TTGGAAAAATATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTACAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGCCACGTTTCCGGCGCCT > 1/1466987‑1467466 | ttGGAAAAATATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATc < 1:483043/251‑1 (MQ=255) tGGAAAAATATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCt < 1:148538/251‑1 (MQ=255) aaTATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCaa > 1:376611/1‑251 (MQ=255) gTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGtt > 1:485400/1‑251 (MQ=255) 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1:842372/1‑232 (MQ=255) aGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATggg > 1:46221/1‑250 (MQ=255) aaTTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAAt > 1:171373/1‑251 (MQ=255) cGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTg < 1:768851/251‑1 (MQ=255) 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cTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGt > 1:653543/1‑251 (MQ=255) ccTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTg > 1:818167/1‑251 (MQ=255) cTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATtgtg > 1:617086/1‑141 (MQ=255) tttATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTATAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAAGCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTtata < 1:497767/251‑1 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TTGGAAAAATATGGTTGTACCGCGTTAAACAGCAAGGTGCTGCGAGACTTTGTGGATGATATGCAGTATGAAGAGGGCTATGATGAAGCCGGAATGGACGAATTAATCCGAAAAGTGGCGGGCTAGAAGGGATCTTGTGCCCCTTTTTTCGCCGATTTTTATAGAATCGTTATCTTGAAAAGAAAACCGTTATAAATTCTTCAAATTTTCACCGCACTTGCTATTTTCAAGCTGTTAAATCCTGTACAATCTAGGCAATTTTTTGTTTAAATAATGCATTGTGAGATCCCTTAATGCTTGAAACATCACAAACAATCCCCGAACTGGTTTCATGGGCGAAAGAACGCGAATTTTCGCTGAATTTACCCACCGATCGTCTGGCGTTTTTATTGGCAATTGCCATTTATAATAACGAACGTTTTGACGGTGAAATGATCGAATCGGATCTGGTGGACATTTTTCGCCACGTTTCCGGCGCCT > 1/1466987‑1467466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |