| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,461,229 | T→C | Y385Y (TAT→TAC) | unknown → | Glycogen synthase, ADP‑glucose transglucosylase (EC 2.4.1.21) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,461,229 | 0 | T | C | 100.0% | 191.9 / NA | 61 | Y385Y (TAT→TAC) | unknown | Glycogen synthase, ADP‑glucose transglucosylase (EC 2.4.1.21) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/33); total (28/33) | |||||||||||
GGCGTGGATTTACTGTTGGAAAGCGCCGATGAAATCGTTAAACAAGGCGGGCAACTTGCGATTCTTGGCTCAGGCGCACCGCACTTGGAAGTGGGAATTCGCAAATTAGCGAAAGATTATCCGCAGAACGTTGCCGTGAAAATCGGCTACGATGAAGCGTTATCCCATTTAATGCTTGCCGGCGGGGATGTGATTTTAGTCCCAAGTCGTTTTGAGCCTT‑GCGGTTTAACCCAATTATATGGACTGAAATACGGCACATTACCATTAGTCCGCGCAACCGGTGGTTTGGCGGATACAGTGGTTAACGCTTCCGTCGAAAATATTCAAACGCGAACAGCAACAGGTTTTGTCTTTACACACGCAACAGCTGATGACTTACGTCATGCGTTGCAAGCGGCATTTGCTTTATGGAAAAAACAACGCTTATGGGCAAGTGTTCGCGTTATTGCAATGGAACAAGATTTCAGTTGGCAAATCTCTGCAAC > 1/1460990‑1461474 | ggCGTGGATTTACTGTTGGAAAGCGCCGATGAAATCGTTAAACAAGGCGGGCAACTTGCGATTCTTGGCTCAGGCGCACCGCACTTGGAAGTGGGAATTCGCAAATTAGCGAAAGATTATCCGCAGAACGTTGCCGTGAATATCGGCTACGATGAAGCGTTATCCCATTTAATACTTGCCGTCGGGGATGTGATTTTTGTGCCAAGTCGATTTTAGCCTT‑GCGGTTTGATCCAATTATACCGCCTGAAATa > 1:261385/1‑251 (MQ=255) 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cTGTTGGAAAGCGCCGATGAAATCGTTAAACAAGGCGGGCAACTTGCGATTCTTGGCTCAGGCGCACCGCACTTGGAAGTGGGAATTCGCAAATTAGCGAAAGATTATCCGCAGAACGTTGCCGTGAAAATCGGCTACGATGAAGCGTTATCCCATTTAATGCTTGCCGGCGGGGAAGTGATTTTAGTCCCAAGTCGGTTTGAGCCTT‑GCGGGTTTACCCCATTTTACGGACTGAAATAAGGCACAATAc > 1:505878/1‑250 (MQ=255) tGTTGGAAAGCGCCGATGAAATCGTTAAACAAGGCGGGCAACTTGCGATTCTTGGCTCAGGCGCACCGCACTTGGAAGTGGGAATTCGCAAATTAGCGAAAGATTATCCGCAGAACGTTGCCGTGAAAATCGGCTACGATGAAGCGTTATCCCATTTAATGCTTGCCGGCGGGGATGTGATTTTAGTCCCAAGTCGTTTTGAGCCTT‑GCGGTTTAACCCAATTATACGGACTGAAATACGGCACATTACCa < 1:149828/251‑1 (MQ=255) tGTTGGAAAGCGCCGATGAAATCGTTAAACAAGGCGGGCAACTTGCGATTCTTGGCTCAGGCGCACCGCACTTGGAAGTGGGAATTCGCAAATTAGCGAAAGATTATCCGCAGAACGTTGCCGTGAAAATCGGCTACGATGAAGCGTTATCCCATTTAATGCTTGCCGGCGGGGATGTGATTTTAGTCCCAAGTCGTTTTGAGCCTT‑GCGGTTTAACCCAATTATACGGACTGAAATACGGCACATTACCa < 1:696286/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |