| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 874,954 | A→G | intergenic (+145/+90) | unknown → / ← unknown | Arginine ABC transporter, permease protein ArtM/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 874,954 | 0 | A | G | 99.1% | 399.7 / NA | 116 | intergenic (+145/+90) | unknown/unknown | Arginine ABC transporter, permease protein ArtM/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (65/50); minor base T (0/1); total (65/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GTGGTATTTATCTGATTATCACCGGTATCGCAACACTCTTGTTGCGCAGACTGGAAAACAAAGTACTTGCCTTTGAGCGCTTGGCTATGAAAAGCGTCTAAAAAGTGCGGTGATTTTTCTGAGCGTTTTTAAAGTAGGCTAAACCCTACAAGAGAACCTGAATAAGGGGATTGCGAAGATTAAGAATAATAATGAATGTCCGAG‑AATTTATGCTAAATGGGTAGTGAAGTAGGTATCGAAAAGTGAGCGGAATGTCGCCCCTTGTTATTTACTATTGGTCATCCGGCAGGCCACAATCAGCACCAATTAAAATTGTCCTAAAATTAAGTGGAATTTCATGTTTTCAGGGTAGTGATATAACATGATTTCTGTGACGGAATCAGTTTTGATAAAGCGTATAACCCGGCGATTTTTTGTTTAAAACATAAGAAATTTATACCGCACTTTTCGTTCAGCATGAAAATGTGATTAATATCACAT > 1/874709‑875188 | gtggtATTTATCTGATTATCACCGGTATCGCAACACTCTTGTTGCGCAGACTGGAAAACAAAGTACTTGCCTTTGAGCGCTTGGCTATGAAAAGCGTCTAAAAAGTGCGGTGATTTTTCTAAGCGTTTTTAAAGTAGGCTAAACCCTACAAGAGAACCTGAATAAGGGGATTGCGAAGATTAAGAATAATAATGAATGTCCGAG‑AATTTATGCTAAATGGGTAGTGAAGTAGGTATCGAAAAGTGGGCGGa > 1:891483/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |