| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 833,193 | T→C | G666G (GGT→GGC) | unknown → | LPS‑assembly protein LptD @ Organic solvent tolerance protein precursor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 833,193 | 0 | T | C | 100.0% | 314.4 / NA | 93 | G666G (GGT→GGC) | unknown | LPS‑assembly protein LptD @ Organic solvent tolerance protein precursor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (43/50); total (43/50) | |||||||||||
GTCCCGCATTGATGATAACCCGAATAATAAAACCTCCGGCGCATCTTCGTCATGGGCATTGGAATCCAACTGGAAAATAAGCGACCAATGGCGTTGGCGCGCAAGTTATCAATATGATCCGCAGTTAAAACAGGTTTCATTGGCAAATACCGGATTAGAATGGAATCCGCAAAAAGAGAATTTAATTCAGTTAACTTACCGTTATGCAAGCCAAAGATATATCGATCAAAACCTGGATGTCGGTGCTAATCGTTATAATCAGGATATTAAACAATTGGGCGTGCAGGCAGCGTGGGAAATCACCGACAATTGGGCGGTGGTCGGGCGTTATTATCAGGATTTGGCGCTGAAGAAACCGGTGGAACAATACCTTGGCGTACAATACAACTCCTGCTGTTGGAGCATCGGTGTAGGCGCCAGACGTTATGTCACCAGCCGCCAAAATCAAAAATATGATGAAATTTTCTATGATAACAGTATTGGCG > 1/832950‑833434 | gTCCCGCATTGATGATAACCCGAATAATAAAACCTCCGGCGCATCTTCGTCATGGGCATTGGAATCCAACTGGAAAATAAGCGACCAATGGCGTTGGCGCGCAAGTTATCAATATGATCCGCAGTTAAAACAGGTTTCATTGGCAAATACCGGATTAGAATGGAATCCGCAAAAAGAGAATTTAATTCAGTTAACTTACCGTTATGCAAGCCAAAGATATATCGATCAAAACCTGGATGTCGGCGCTAAt > 1:691726/1‑250 (MQ=255)gTCCCGCATTGATGATAACCCGAATAATAAAACCTCCGGCGCATCTTCGTCATGGGCATTGGAATCCAACTGGAAAATAAGCGACCAATGGCGTTGGCGCGCAAGTTATCAATATGATCCGCAGTTAAAACAGGTTTCATTGGCAAATACCGGATTAGAATGGAATCCGCAAAAAGAGAATTTAATTCAGTTAACTTACCGTTATGCAAGCCAAAGATATATCGATCAAAACCTGGATGTCGGCGCTAAt > 1:129909/1‑250 (MQ=255)gTCCCGCATTGATGATAACCCGAATAATAAAACCTCCGGCGCATCTTCGTCATGGGCATTGGAATCCAACTGGAAAATAAGCGACCAATGGCGTTGGCGCGCAAGTTATCAATATGATCCGCAGTTAAAACAGGTTTCATTGGCAAATACCGGATTAGAATGGAATCCGCAAAAAGAGAATTTAATTCAGTTAACTTACCGTTATGCAAGCCAAAGATATATCGATCAAAACCTGGATGTCGGCGCTAAt > 1:578396/1‑250 (MQ=255) tCCCGCATTGATGATAACCCGAATAATAAAACCTCCGGCGCATCTTCGTCATGGGCATTGGAATCCAACTGGAAAATAAGCGACCAATGGCGTTGGCGCGCAAGTTATCAATATGATCCGCAGTTAAAACAGGTTTCATTGGCAAATACCGGATTAGAATGGAATCCGCAAAAAGAGAATTTAATTCAGTTAACTTACCGTTATGCAAGCCAAAGATATATCGATCAAAACCTGGATGTCGGCGCTAATc < 1:668826/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |