| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 779,310 | G→A | S40S (TCC→TCT) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 779,310 | 0 | G | A | 100.0% | 282.3 / NA | 83 | S40S (TCC→TCT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (37/46); total (37/46) | |||||||||||
TTCTTAACCGTATAGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTGGATTTAATTCTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAGCATATAAAAACAAATATGTTTTTATGCG > 1/779066‑779548 | ttCTTAACCGTATAGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTa > 1:172116/1‑251 (MQ=255) ataGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTtc < 1:647162/251‑1 (MQ=255) gATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTtctc > 1:494770/1‑250 (MQ=255) atatGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCg > 1:623180/1‑251 (MQ=255) cGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAAc < 1:96777/251‑1 (MQ=255) atTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCg > 1:362266/1‑245 (MQ=255) atTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCg > 1:500174/1‑245 (MQ=255) atTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCaaa > 1:313485/1‑251 (MQ=255) ttATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCg < 1:392137/244‑1 (MQ=255) gTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATAc < 1:727580/250‑1 (MQ=255) gTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATAc < 1:506439/250‑1 (MQ=255) cTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGAt < 1:275858/202‑1 (MQ=255) cTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAAc < 1:630338/229‑1 (MQ=255) cTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATActtctt > 1:897615/1‑251 (MQ=255) aCATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAAc < 1:545803/227‑1 (MQ=255) aCATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCg < 1:179950/229‑1 (MQ=255) aTAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAAc > 1:198054/1‑225 (MQ=255) aTAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCg < 1:734928/227‑1 (MQ=255) tAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGaa < 1:726771/251‑1 (MQ=255) ggATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAg > 1:715473/1‑251 (MQ=255) ggATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAg > 1:413180/1‑251 (MQ=255) gTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAAcc < 1:522284/218‑1 (MQ=255) tttGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACtt < 1:699369/251‑1 (MQ=255) gTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCTGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACATTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTATCCGTTATCTAACCGAGc > 1:803430/1‑210 (MQ=255) gTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATAc < 1:498433/222‑1 (MQ=255) gTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTa > 1:766805/1‑251 (MQ=255) ctctAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGAt < 1:647767/251‑1 (MQ=255) ctctAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGAt < 1:135709/251‑1 (MQ=255) ctctAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGAt < 1:461262/251‑1 (MQ=255) ctAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAAtt < 1:582745/185‑1 (MQ=255) ctAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAg > 1:601556/1‑251 (MQ=255) tGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTg < 1:539476/251‑1 (MQ=255) tttCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCatat < 1:207205/251‑1 (MQ=255) tGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGc < 1:34330/251‑1 (MQ=255) gCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGaa > 1:405738/1‑192 (MQ=255) aCTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCataat < 1:337669/251‑1 (MQ=255) aCTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTCCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCataa < 1:454064/250‑1 (MQ=255) cTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCGAAAAACAATACTTCTTCGGaa < 1:554187/185‑1 (MQ=255) cTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAg > 1:560993/1‑205 (MQ=255) cTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCataata > 1:575225/1‑251 (MQ=255) aTCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATaataat > 1:316304/1‑251 (MQ=255) aTCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCATCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCa < 1:17167/232‑1 (MQ=255) aTACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAgg < 1:535723/237‑1 (MQ=255) aCAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTc > 1:54255/1‑249 (MQ=255) aCAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCCCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTc > 1:595568/1‑249 (MQ=255) aaaTAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTaactttaat > 1:552234/1‑125 (MQ=255) aaaTAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTc > 1:867116/1‑219 (MQ=255) aTAAAGCGAGCTTGTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACtt < 1:431891/183‑1 (MQ=255) aaGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTaaaa < 1:253638/251‑1 (MQ=255) ttCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATAc > 1:87107/1‑149 (MQ=255) tCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACtt < 1:648153/168‑1 (MQ=255) tAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGGCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATc < 1:277438/251‑1 (MQ=255) ctgctgctCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATc < 1:630580/119‑1 (MQ=255) ctgctgctCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCa > 1:473074/1‑240 (MQ=255) tCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCg < 1:859939/251‑1 (MQ=255) cGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATc > 1:889129/1‑236 (MQ=255) ccGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAg < 1:500328/251‑1 (MQ=255) gTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAgtcgtc < 1:685162/160‑1 (MQ=255) gTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCttt < 1:526093/163‑1 (MQ=255) gTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCatat > 1:569025/1‑183 (MQ=255) gTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTcc > 1:863881/1‑203 (MQ=255) tCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCaa < 1:716382/251‑1 (MQ=255) aaaaaacgaactttttctgTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACt < 1:723304/232‑1 (MQ=255) gtgtAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCt < 1:152055/89‑1 (MQ=255) gtgtAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGAt < 1:264357/141‑1 (MQ=255) gtgtAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCataat > 1:131669/1‑184 (MQ=255) gtgtAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGAt > 1:624756/1‑220 (MQ=255) gtgtAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAAc > 1:69249/1‑249 (MQ=255) gtgtAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACAt > 1:284637/1‑251 (MQ=255) aTCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAata < 1:94911/251‑1 (MQ=255) aTTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAg < 1:587518/251‑1 (MQ=255) ttttAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGc < 1:465852/161‑1 (MQ=255) gTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACt > 1:765036/1‑106 (MQ=255) gTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAg > 1:752043/1‑250 (MQ=255) tctcCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGc < 1:415180/144‑1 (MQ=255) ctcCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGa < 1:179057/126‑1 (MQ=255) aGGTTAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAGCATATaaa < 1:654542/242‑1 (MQ=255) tAGCTAACACTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGacaac > 1:734837/1‑190 (MQ=255) cacTTCTTCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGCTAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAGCATATAAAAACAAATATGTTTTTATGCg > 1:441258/1‑251 (MQ=255) cttcttCATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCaa > 1:779827/1‑189 (MQ=255) ttcttcATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAAc < 1:651000/197‑1 (MQ=255) tcATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAgt > 1:725863/1‑88 (MQ=255) tcATTAGATTTAACTTTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAAc > 1:298682/1‑193 (MQ=255) | TTCTTAACCGTATAGATATGAAATCGACCATCATTATAAGCGGTTGCTACATAGGATAGTTTTTGGGTCAGTTCTCTAATTTCCTGGTAAAAACGAAAAGAAATTTCCTTGCTTTGACTATCATACAAAATAAAGCGAGCTTTTTCTAAAAGCTGCTGCTCCGCTTCTTCCGTCCAAACCACGGTGTAATCCAGTTTCATTTTAAGTCCAATACTTTCTCCAGGTTAGCTAACACTTCTTCATTGGATTTAATTCTAATTTCTCCGTTATCTAACCGAGCAAAAAACAATACTTCTTCGGAAAGTGTCACTTTCTGCGGTAGATAGTCGTCTTTGCGGTAGGATTCTTGCATATTTAGGCTCATAATAATTTCCTCGCTAAAAAGTTAGTCATAATCATAGATAAAACCGACAACAATAGCAACTTATTAACATAAATATGCTAATAAGATTAAGCATATAAAAACAAATATGTTTTTATGCG > 1/779066‑779548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |