| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 777,780 | T→C | D468D (GAT→GAC) | unknown → | Coupling protein VirD4, ATPase required for T‑DNA transfer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 777,780 | 0 | T | C | 100.0% | 407.9 / NA | 118 | D468D (GAT→GAC) | unknown | Coupling protein VirD4, ATPase required for T‑DNA transfer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (54/64); total (54/64) | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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atATGCACCCGACAACCAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGat > 1:677598/2‑151 (MQ=255) atATGCACCCGACAACCAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATatgt < 1:894996/207‑1 (MQ=255) ccAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTAc > 1:79394/2‑211 (MQ=255) | AAATATCAGTTATTACTACTCATGGATGAGTTTACTGCGGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGCTATGGTTTACGCCTATTGATTATCTATCAATCACAAGGGCAACTTCGTGCCGATAAGCCTAATGGTTACGGTAAAGATGGTGCTAAAGCTATCCTGGATAATATTGCCTGTAAAATTCTGTATGCTCCCGACAATCAGGAGGATGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAGATAAATTAAGCCATAGTCGCGGAAAAACTTCCAGTCACAGTATTACCGACCACGGACGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAATTTAGACTAATAGGAGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATGTGTAATAAGGCGGTGTATTACAACGACCCTTATTTCATCGA > 1/777550‑778001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |