| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 777,660 | C→T | I428I (ATC→ATT) | unknown → | Coupling protein VirD4, ATPase required for T‑DNA transfer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 777,660 | 0 | C | T | 100.0% | 291.5 / NA | 85 | I428I (ATC→ATT) | unknown | Coupling protein VirD4, ATPase required for T‑DNA transfer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/45); total (40/45) | |||||||||||
GAAAAAATCACGATTTATTTCCACATTTCGGCAAATGATTTAATCCTGGCTCCGCAAGTCGCTAATCTGTTTATGAGCATGGTTATTGCCAACAATATTGATGAACTACCGGAAACCAACCCGAAATTAAAATATCAGTTATTACTACTCATGGATGAGTTTACTGCGGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGCTATGGTTTACGCCTATTGATTATCTATCAATCACAAGGGCAACTTCGTGCCGATAAGCCTAATGGTTACGGTAAAGATGGTGCTAAAGCTATCCTGGATAATATTGCCTGTAAAATTCTGTATGCTCCCGACAATCAGGAGGATGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAGATAAATTAAGCCATAGTCGCGGAAAAACTTCCAGTCACAGTATTACCGACCACGGACGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAAT > 1/777421‑777901 | gAAAAAATCACGATTTATTTCCACATTTCGGCAAATGATTTAATCCTGGCTCCGCAAGTCGCTAATCTGTTTATGAGCATGGTTATTGCCAACAATATTGACGAACTACCGGAAACCAACCCAACATTAAAATATCAGTTATTACTACTAATGGATGAGTTTACTGCCGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGTTATGGTTTACGCCTATTGATTATTTATCAATcaca > 1:569374/1‑251 (MQ=255) 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GAAAAAATCACGATTTATTTCCACATTTCGGCAAATGATTTAATCCTGGCTCCGCAAGTCGCTAATCTGTTTATGAGCATGGTTATTGCCAACAATATTGATGAACTACCGGAAACCAACCCGAAATTAAAATATCAGTTATTACTACTCATGGATGAGTTTACTGCGGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGCTATGGTTTACGCCTATTGATTATCTATCAATCACAAGGGCAACTTCGTGCCGATAAGCCTAATGGTTACGGTAAAGATGGTGCTAAAGCTATCCTGGATAATATTGCCTGTAAAATTCTGTATGCTCCCGACAATCAGGAGGATGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAGATAAATTAAGCCATAGTCGCGGAAAAACTTCCAGTCACAGTATTACCGACCACGGACGACCGTTGCTTTTACCGCAGGAAT > 1/777421‑777901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |