| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 680,739 | A→G | V567A (GTG→GCG) | unknown ← | VgrG protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 680,739 | 0 | A | G | 100.0% | 293.1 / NA | 83 | V567A (GTG→GCG) | unknown | VgrG protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (39/44); total (39/44) | |||||||||||
GCTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCACATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAATCTCCTCCCCCTTCGGACCGGTCA > 1/680499‑680979 | gCTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAgg < 1:184068/250‑1 (MQ=255) cTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGtt < 1:20129/251‑1 (MQ=255) ccGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGcc < 1:316941/250‑1 (MQ=255) aaCTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTa > 1:327326/1‑251 (MQ=255) 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ttATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACtg < 1:136012/216‑1 (MQ=255) ttATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGaa < 1:512619/251‑1 (MQ=255) taGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTg < 1:121572/251‑1 (MQ=255) gTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGccacc > 1:544293/1‑156 (MQ=255) 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gggTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCg > 1:821994/1‑251 (MQ=255) ttgtGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAAt > 1:154272/1‑249 (MQ=255) tgGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCGCATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAAc < 1:265269/217‑1 (MQ=255) 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GCTTTGCCGACACTAACTTTCTGTTCGCCTTTGACGGTTTCTTTGTGATTCCCGCCCACATTAGTGGCACGGTCATTGAGCACTAAGGTATTCATATCCCGCTGAGCCTGGAAGTCCAAGCGTTGTTTACCCTGCTCATCTTCCATCATCATCCCATTATAACCACCGCCCTTATAGGTCTGTGACATCAGATGCATCTGGGTTTTGTTTTGTGGTAATTTGGCCGGCAACGGCATATTCACATGGTAGGTTCGCCCGGTGACTATCGGCTGGTCGGGGTCGCCTTCTAAAAAGTCTACCATCACCTCATGACCGACCCGAGGAATCGCCACCATCCCCCAGCCTTTACCCGCCCAAGGTTGGGTTACCCGCACCCAACAAGAACTGTGGTCATCATACTTGCCTTCCCTGTCCCATAAGAATTGTAACCGCACCCGTCCAAAGTTATCGGTATAAATCTCCTCCCCCTTCGGACCGGTCA > 1/680499‑680979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |