| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 628,593 | T→C | *387Q (TAG→CAG) | unknown → | USG protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 628,593 | 0 | T | C | 100.0% | 218.4 / NA | 61 | *387Q (TAG→CAG) | unknown | USG protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/30); total (31/30) | |||||||||||
TCTCAAGAGATTTTAAAACTAGGGTATCGTATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTATAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGTTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGAAAATATTTCGCTAGATGAATTAAGATCTAATAT > 1/628353‑628807 | tctcAAGAGATTTTAAAACTAGGGTATCGTATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGaaa < 1:231319/251‑1 (MQ=255) 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tATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCag < 1:700107/247‑1 (MQ=255) gTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGa < 1:318738/223‑1 (MQ=255) gTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAAtt > 1:47857/1‑251 (MQ=255) 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aCAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAaac < 1:341768/251‑1 (MQ=255) aTTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAAct > 1:8405/1‑250 (MQ=255) tAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTgg < 1:546620/251‑1 (MQ=255) 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ctctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGAAAATATTTCGCTAGATGAATTAAGa > 1:54701/1‑235 (MQ=255) ctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGCATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGTAGGAGGAATTTGATATTTCCTAAAGGAATGGAAATGATTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGCATATATGGCAAAACAACTCTGGGTTAATGAGATGAATAAAGAGt > 1:449386/1‑165 (MQ=255) ctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGaa < 1:22010/182‑1 (MQ=255) ctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGa < 1:182057/208‑1 (MQ=255) ctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGAAAATATTTCGCTAGATGAATTAAGATc < 1:798125/235‑1 (MQ=255) ctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGAAAATATTTCGCTAGATGAATTAAGATCTAatat < 1:50116/241‑1 (MQ=255) ctATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGAAAATATTTCGCTAGATGAATTAAGATCTAatat > 1:92061/1‑241 (MQ=255) tttCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCt > 1:480501/1‑198 (MQ=255) ataaatTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAag > 1:255039/1‑144 (MQ=255) aaatTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGAt < 1:445234/126‑1 (MQ=255) aaatTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAagg > 1:306084/1‑154 (MQ=255) | TCTCAAGAGATTTTAAAACTAGGGTATCGTATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTATAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGTTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATAAAGAGTCTGCTAAGGAGGTTGAAAATGAAATGCAAGCACTATCTAAAGAAAATATTTCGCTAGATGAATTAAGATCTAATAT > 1/628353‑628807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |