| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,481,396 | 0 | A | T | 67.8% | 86.9 / 59.7 | 59 | intergenic (+47/‑962) | unknown/unknown | Zona occludens toxin‑like phage protein/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/7); new base T (19/21); total (31/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTATTGATGAAGTGTGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGAGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGATAACTGAAGGCGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GGAAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCGCTGATGATTT > 1/1481150‑1481637 | gTATTGATGAAGTGTGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGttt > 1:51487/1‑251 (MQ=255)gTATTGATGAAGTGTGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGttt > 1:356478/1‑251 (MQ=255) gatgaAGTGTGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGt > 1:453597/1‑251 (MQ=255) gtgtGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGtt > 1:268365/1‑239 (MQ=255) gtgtGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGa > 1:422482/1‑248 (MQ=255) aTTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAAc < 1:744671/251‑1 (MQ=255) ttttCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTATAAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAAc < 1:342888/251‑1 (MQ=255) 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tttATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGATAACTGAAGGCGAAACAGGtttcacgttgtaagct < 1:245385/251‑14 (MQ=255) cGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCAAAAACAAGATAACTg > 1:439398/1‑185 (MQ=255) cGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGATAACTGAAGGCGAAACAGGtttcacgttgtaagct < 1:466489/210‑14 (MQ=255) taATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAAc < 1:896693/147‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCTGAAAATAAGATAACTGAAGGCGAAACAGGTTTTACGTTGTTTGCTATAGGATATTTCACGTGAAAACCGAAAAATGATACTAAGTTAGAGATGGTTATTTTATTCCAAGTgtaagttggg > 1:769522/1‑242 (MQ=255) gTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGATAACTGAAGGCGAAACAGGtttcacgttgtaag > 1:211439/1‑163 (MQ=255) atctaattttgttaagacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTc < 1:735103/218‑1 (MQ=255) atctaattttgttaagacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑tttttga > 1:897988/21‑248 (MQ=255) attttgttaagacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑tttttgagcaag > 1:47361/16‑243 (MQ=255) gacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAAc < 1:598161/157‑1 (MQ=255) gacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAc < 1:356024/184‑1 (MQ=255) gacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTa < 1:645917/220‑1 (MQ=255) gacggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑tttttgagcaagctcaaaaatg > 1:631333/6‑233 (MQ=255) aCCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAg > 1:65944/1‑86 (MQ=255) ggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGttcttggt > 1:394217/3‑85 (MQ=255) ggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAATAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑tttttgagcaagctcaaaaatgtag > 1:92644/3‑230 (MQ=255) ggataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAc > 1:126598/3‑186 (MQ=255) gTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGAt > 1:469852/1‑111 (MQ=255) gataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTg > 1:710266/2‑195 (MQ=255) gataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑tttttgagcaagctcaaaaatgtagg > 1:60513/2‑229 (MQ=255) ataCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCAt > 1:216121/1‑135 (MQ=255) taCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTg < 1:573317/193‑1 (MQ=255) taCAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTAc > 1:740583/1‑200 (MQ=255) gtgtTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGATAACTg > 1:501948/1‑108 (MQ=255) atcTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCaaaa < 1:858884/155‑1 (MQ=255) acacTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaac < 1:828510/251‑2 (MQ=255) acacTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTCTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaac < 1:639394/251‑2 (MQ=255) cacTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaacc < 1:119271/251‑3 (MQ=255) acTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaacca < 1:283417/251‑4 (MQ=255) cTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGAc < 1:700016/158‑1 (MQ=255) t‑aAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTc < 1:21991/251‑1 (MQ=255) aaaCGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaac > 1:882242/1‑241 (MQ=255) aCGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATg < 1:871823/251‑1 (MQ=255) cgcgACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGt < 1:796521/251‑1 (MQ=255) cgACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTa < 1:624089/251‑1 (MQ=255) gTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCggg > 1:315815/1‑250 (MQ=255) tCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGatat > 1:119379/1‑145 (MQ=255) tCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGt < 1:92661/241‑1 (MQ=255) tCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGc < 1:251811/250‑1 (MQ=255) tCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCa > 1:321878/1‑251 (MQ=255) gATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCaaaaa > 1:435792/1‑122 (MQ=255) gATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGa < 1:472060/145‑1 (MQ=255) gATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCAtttt > 1:791560/1‑250 (MQ=255) aTGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACt < 1:595573/163‑1 (MQ=255) aTGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTa > 1:18069/1‑251 (MQ=255) tAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAGCCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTAttt < 1:721810/251‑1 (MQ=255) gtgtAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTg > 1:645560/1‑137 (MQ=255) gtAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAg < 1:602292/133‑1 (MQ=255) aTGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTgcgcgtacctaaatt > 1:212832/1‑241 (MQ=255) | GTATTGATGAAGTGTGGCGTATTTTCCCGACTAATGAAATTAAATCCAATCATCGGTCTTTTATTGCCGAACATCGTCATTTTACCGATGAAGAAACGGGCGTTTGTTGTGATTTAGTTGTTATTAATCAGTCTGTTGCAGGCATTCCTCGGTTTGTCAAAGACCGTATACAGGTGTTAATCAATCTCCGACACTTAT‑AAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGAGATGTGATAGTTTTGGGTGGACTGGCCGAAAACAAGATAACTGAAGGCGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GGAAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCGCTGATGATTT > 1/1481150‑1481637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |