| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 27,211 | (TTTC)2→1 | intergenic (‑369/+92) | unknown ← / ← unknown | Multidrug resistance transporter => Bicyclomycin resistance protein Bcr‑1/hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 27206 | 27209 | 4 | 90 [0] | [0] 89 | unknown/unknown | Multidrug resistance transporter => Bicyclomycin resistance protein Bcr‑1/hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 27210 = | 0 (0.000) | 88 (1.030) | 64/420 | 0.2 | 100% | intergenic (‑368/+96) | unknown/unknown | Multidrug resistance transporter => Bicyclomycin resistance protein Bcr‑1/hypothetical protein |
| ? | 1 | = 27205 | 0 (0.000) | intergenic (‑363/+101) | unknown/unknown | Multidrug resistance transporter => Bicyclomycin resistance protein Bcr‑1/hypothetical protein | |||||
GTAAATTTTACACATGAATAACGACTAATCGCCCTCAAATTTAACGCAGAATCATCATATAAACATAAACAAAAACGACGGGTATTACCCCGCCGTTTTTGTCTGCCTGTTCGGCAGTGAATGAGTAGAGCTTAACTACTATTTTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACTTTCAGTAAGAGCTACCATTTTCTAAGCTGCTTATTCAGCAGTTAAGCTTTGTTTGCTTCAACACTCAGCCTTTCTTTCAGGCTGCATAAAACCGCCACCGCCAGATTGCTCTGGCATTTTAAATCTTAATCCTTTTAATTGCCGGCAGTCAACTTATTTTTAACTATCATTAATCTTTTTCCGCTACAGCTTGCTCAAATAAATCTAATGCCTCATCTCTATTAAATTTAGCTCCCGCATCTTGTAGAAAATCCAAGTGTGCGTCTGCACATTCTCTCGAATAGTCATCATACCCGCTTTCTTCGCATGCGATTAAAG > 1/26966‑27454 | ctacgtaaattttacacatgaataacgactaatcgccctcaaatttaacgcaaaatcatcatataaacataaacaaaaacgacgggtattcccccgccgtttttgtctgcctgttcggcagtgaatgagtagagcttaactactattttctaagctgcctgttcggcagtgaactttcagtaagagctaccattttctaagctgcttattcagcagttaagctttgtttgcttcaacactcagcCTTTCAg > 1:793873‑M1/245‑251 (MQ=255) 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actaatcgccctaaaattaaccgcagaaccataataaaaacaaaaacaaaaccgaggggtattcccccgccgtttttgtctgcctgttcggcagtgaatgagtagagcttaactactattttctaagctgcctgttcggcagtgaactttcagtaagagctaccattttctaagctgcttattcagcagttaagctttgtttgcttcaacactcagcCTTTCAGGCTGCATAAAACCGCCACCGCCAGAt > 1:279353‑M1/218‑250 (MQ=255) atcgccctcaaatttaacccaaaatcatcatataaacaaaaacaaaaacgacgggtattcccccgccgtttttgtctgcctgttcggcagtgaatgagtagagcttaactactattttctaagctgcctgttcggcagtgaactttcagtaagagctaccattttctaagctgcttattcagcagttaagctttgtttgcttcaacactcagcCTTTCAGGCTGCATAAAACCGCCACCGCCAGATTGctc > 1:421794‑M1/214‑251 (MQ=255) ccctcaaatttaacgcagaatcatcatataaacataaacaaaaacgacgggtattaccccgccgtttttgtctgcctgttcggcagtgaatgagtagagcttaactactattttctaagctgcctgttcggcagtgaactttcagtaagagctaccattttctaagctgcttattcagcagttaagctttgtttgcttcaacactcagcCTTTCAGGc < 1:691838‑M1/9‑1 (MQ=255) 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cCTTTCAGGCTGCATAAAACCGCCACCGCCAGATTGCTCTGGCATTTTAAATCTTAATCCTTTTAATTGCCGGCAGTCAACTTATTTTTAACTATCATTAATCTTTTTCCGCTACAGCTTGCTCAAATAAATCTAATGCCTCATCTCTATTAAAt > 1:676878‑M1/2‑155 (MQ=255) | GTAAATTTTACACATGAATAACGACTAATCGCCCTCAAATTTAACGCAGAATCATCATATAAACATAAACAAAAACGACGGGTATTACCCCGCCGTTTTTGTCTGCCTGTTCGGCAGTGAATGAGTAGAGCTTAACTACTATTTTCTAAGCTGCCTGTTCGGCAGTGAACTTTCAGTAAGAGCTACCATTTTCTAAGCTGCTTATTCAGCAGTTAAGCTTTGTTTGCTTCAACACTCAGCCTTTCTTTCAGGCTGCATAAAACCGCCACCGCCAGATTGCTCTGGCATTTTAAATCTTAATCCTTTTAATTGCCGGCAGTCAACTTATTTTTAACTATCATTAATCTTTTTCCGCTACAGCTTGCTCAAATAAATCTAATGCCTCATCTCTATTAAATTTAGCTCCCGCATCTTGTAGAAAATCCAAGTGTGCGTCTGCACATTCTCTCGAATAGTCATCATACCCGCTTTCTTCGCATGCGATTAAAG > 1/26966‑27454 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |