| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,903,171 | (TTTG)20→12 | coding (48‑79/114 nt) | unknown → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1903155 = | 1 (0.010) | 61 (0.900) | 43/334 | 0.4 | 98.6% | coding (32/114 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | = 1903122 | 1 (0.010) | intergenic (+151/‑2) | unknown/unknown | Formate dehydrogenase O alpha subunit (EC 1.2.1.2) @ selenocysteine‑containing/hypothetical protein | |||||
GAATCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCC > 1/1902875‑1903369 | gAATCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCTttt < 1:586855‑M2/251‑4 (MQ=255) 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GAATCCGCTTCATCCGAATGTGGTATCAGATCCGACGGTGCGTATTTACAAAGAAGATCGCGAGTTTATCGGCTCAAATAAAGAATATCCGTTGTAGCCGACCACGCGAGTTTAGAAATTTAACCAGTTAAATTTAGAAGAGGAATTTCTAATTTTATGCGAACTTAGGAAGACAATAACGCTACACCAATTTTACCTATCAACACCGACTAATGGTAGGGGTGCTTGTTTAAACATAGCACGCTCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCATTGTATATGTCCTTTTTTATTGTCAAATTTTGATTATAAAAATGCAGTGGATTTTTACGGCGTTTTGAAAATCACTTATGTCCCACCCGAATTGTAATATCCCTAAATGCCAGCGCGTTGCGGCTAATGCCCGGCTGTACCTCAATGCGCAGACGAATTTTATCC > 1/1902875‑1903369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |