| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | = 1703926 | 52 (0.590) | intergenic (‑495/+89) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
TTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCT > 1/1703665‑1704141 | tttCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCTTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTC > 1:441509‑M2/1‑251 (MQ=255) 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cAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattcttatcaacacatcccctgcgctcctgccccccgcaaaaacacttgagcgttgtatggctaagcccctcgggcaattagtacgtgttagctcaacatatcactacgcttacacac > 1:399213‑M2/1‑90 (MQ=255) cAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattcttatcaacacatcccctgcgctcctgccccccgcaaaaacacttgagcgttgtatggctaagcccctcgggcaattagtacgtgttagctcaacatatcactacgcttacacaccacgcctatctac > 1:80648‑M2/1‑77 (MQ=255) aaCCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTctctttctctttatctttctctttaatttaatctaataccgttattcttatcaacacatcccctgcgctcctgccccccgcaaaaacacttgagcgttgtatggctaagcccctcgggcaattagtacgtgttagctcaacatatcactacgcttacacaccacgcctatctacgt > 1:593229‑M2/1‑75 (MQ=255) 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TTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAACAAGCCTCAAACCAACTTCCTTCCCTCAACTCCCTCTCCTGAGCTACAATCCTTTTTCTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTATCTTTCTCTTTAATTTAATCTAATACCGTTATTCTTATCAACACATCCCCTGCGCTCCTGCCCCCCGCAAAAACACTTGAGCGTTGTATGGCTAAGCCCCTCGGGCAATTAGTACGTGTTAGCTCAACATATCACTACGCTTACACACCACGCCTATCTACGTCATAGTCTTTAACAACCCTTACAGACCTAAAGTCTGGGAGAACTCATCTCT > 1/1703665‑1704141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |