| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 686,834 | +ATT | coding (223/351 nt) | unknown ← | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 686831 | 0 (0.000) | 65 (0.750) +ATT |
52/418 | 0.4 | 100% | coding (226/351 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 686832 = | 0 (0.000) | coding (225/351 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
TCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAAT > 1/686604‑687079 | tcctccAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCattatttttg < 1:617898‑M1/238‑11 (MQ=255) 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atcattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagttaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattctccctgtaagat < 1:448769‑M1/251‑249 (MQ=255) atcattatttttgtatgcttcaatagatgtaaatccttcttgtttgtttatctgtaaagtcaaacgatctccaataagtaagctttctatagttttgggttgtggtgatattaattgagtgcttttttgtagtaattcacatgatgacgcactattacctccttcaaagcctcctataccattattaaagatcgggttatttgaaaaatcactattaccgctgccagacatatgtattctccctgtaagat < 1:391189‑M1/251‑249 (MQ=255) | TCCTCCAGAACCGTATAATTCATCCCAATGTGGCCAAGCGCACCGCTCAATATATACACCACCAATAACAGTAATACATTTATTATTTGACATAATTAAGACTCAGATATGTTTGATAGATACTTGAACTTGTCCTTCAATAATACTTTCTACAATAGCTATATATTTATGACCGTTCTCCATGCAAGTGAGGAGTTGTGGAAGTACAATCCCTCCCGCTCTATCATCATTTTTGTATGCTTCAATAGATGTAAATCCTTCTTGTTTGTTTATCTGTAAAGTTAAACGATCTCCAATAAGTAAGCTTTCTATAGTTTTGGGTTGTGGTGATATTAATTGAGTGCTTTTTTGTAGTAATTCACATGATGACGCACTATTACCTCCTTCAAAGCCTCCTATACCATTATTAAAGATCGGGTTATTTGAAAAATCACTATTACCGCTGCCAGACATATGTATTCTCCCTGTAAGATAAT > 1/686604‑687079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |