| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,485,158 | 2 bp→GA | intergenic (‑40530/‑156605) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,485,158 | 0 | C | G | 100.0% | 245.1 / NA | 89 | intergenic (‑40530/‑156606) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (61/28); total (61/28) | |||||||||||
| * | 1 | 1,485,159 | 0 | T | A | 100.0% | 256.0 / NA | 89 | intergenic (‑40531/‑156605) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (61/28); total (61/28) | |||||||||||
TTACCGCCCATTATTTATCTCCTTCGTTGGCCTCTAAGGCCGCAGCAACACATTTGCGCGCAAATACACTGCCGGTGTTTAAAAGCACGCGCGAATCAATGCCATGTTGTAAAAAATCGGCATAATCTAACCCTTCGCGCATAAAAAACGCCTCGACGCCGTAAGGGCAAAAATCCACCCGGCGCATGTCTTGCATTGTGATAATAATGCTATCCATAAATTAACCCTTTTTAATCTCGCTCGTGCGGTAGTTGCCGTAAGCCAGCACCTGCCAATCCTCGGTCCAGCAATCGCCGAAAAACACACACTGCGGCGTACCCTCGTCGATTTGCGGAAAATTAAAATCCTTGGCGCTGGCTGCCTCCGGTCCGTTACTGCCGCGCTTACCGAACGCCCGATTGATGTAATAACTGGCAACGGCATAGGCGACGATTTTAACGATTGCCCAGGCAATTGATGCAAACATAATCAAATCCCTCTAAAA > 1/1484919‑1485402 || ttACCGCCCATTATTTATCTCCTTCGTGGGCCTCTAAGGCCGCAGCAACACATTTGCGCGCAAATACACTGCCGGTGTTTAAAAGTACGCGCGAATCAATGCCATGTTGTAAAAAATCGGCATAATCTAACCCTTCGCGCATAAAAAACGCCTCGACGCCGTAAGGGCAAAAATCCACCCGGCGCATATCCTGCATTGTGATAGTAATGCTATCCATAAATTTACCCTTTTTAATCTCGGACGTGCGGTAg < 1:331680/251‑1 (MQ=255) 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1:226819/1‑247 (MQ=255) aaTCTCGGACGTGCGGTAGTTGCCGTAAGCCAGCACTTGCCAATCCTCAGTCCAGCAATCGCCGAAAAAAACACATTGCGGCGTACCCTCGTCAATTTGCGGAAAATTGAAATCCTTGGCGCTTGCTGCCTCCGGTCCGTTACTGCCGCGCTTACCGAACGCCCGATTGATGTAATAACTGGCAACAGTATACGCGACGATTTTAACGATTGCCCAAGCAATTGATGCAAACATAAT‑AAATCCTCCTaaaa < 1:868305/251‑1 (MQ=255) aaTCTCGGACGTGCGGTAGTTGCCGTAAGCCAGCACTTGCCAATCCTCAGTCCAGCAATCGCCGAAAAAAACACATTGCGGCGTACCCTCGTCAATTTGCGGAAAATTGAAATCCTTGGCGCTTGCTGCCTCCGGTCCGTTACTGCCGCGCTTACCGAACGCCCGATTGATGTAATAACTGGCAACAGTATACGCGACGATTTTAACGATTGCCCAAGCAATTGATGCAAACATAAT‑AAATCCTCCTaaaa > 1:874183/1‑251 (MQ=255) || TTACCGCCCATTATTTATCTCCTTCGTTGGCCTCTAAGGCCGCAGCAACACATTTGCGCGCAAATACACTGCCGGTGTTTAAAAGCACGCGCGAATCAATGCCATGTTGTAAAAAATCGGCATAATCTAACCCTTCGCGCATAAAAAACGCCTCGACGCCGTAAGGGCAAAAATCCACCCGGCGCATGTCTTGCATTGTGATAATAATGCTATCCATAAATTAACCCTTTTTAATCTCGCTCGTGCGGTAGTTGCCGTAAGCCAGCACCTGCCAATCCTCGGTCCAGCAATCGCCGAAAAACACACACTGCGGCGTACCCTCGTCGATTTGCGGAAAATTAAAATCCTTGGCGCTGGCTGCCTCCGGTCCGTTACTGCCGCGCTTACCGAACGCCCGATTGATGTAATAACTGGCAACGGCATAGGCGACGATTTTAACGATTGCCCAGGCAATTGATGCAAACATAATCAAATCCCTCTAAAA > 1/1484919‑1485402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |