| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,484,149 | 2 bp→AC | intergenic (‑39521/‑157614) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | 1 | 1,484,149 | 0 | G | A | 100.0% | 248.8 / NA | 88 | intergenic (‑39521/‑157615) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (45/43); total (45/43) | |||||||||||
| * | 1 | 1,484,150 | 0 | G | C | 100.0% | 240.0 / NA | 88 | intergenic (‑39522/‑157614) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (45/43); total (45/43) | |||||||||||
ATAACCTGATTTGCCTGCTTGTCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCTTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCTTGCCGAATCAATTTAATCGCCTGTTTACCGGTCTCCACATTGTCGTATTGCGCCGCCCCGATATGATCAACAATTTGCTTAATAAAATCTTTAATGGAGGTTTGCCGGTTGTAGCGGATACAGAGGCCAAATCCCTCATCGAAAAGCGTATCTGCCGCTTTTTTATAGCTGTCTAAATCCAGCTCTGATAAGTCTTTTTTGCCGCCCCAGCTTTTATTAGTGGCGCATTCAACCAGGATATGTGCCGGGTTCATGGCGTGGATTTGGCGTACATTTTGTTCTTGTTCGGCTGTCAAACCTTTAATTTTAAGATTGTCATTGCGCAGCAGGATTTTGGCTTTTTCGGCGTACCATACCACGCCA > 1/1483920‑1484387 || atgatttggtttGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAg < 1:848799/242‑1 (MQ=255) gatttggtttGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAgtg > 1:508578/8‑249 (MQ=255) tttggtttGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAGTGTa < 1:25334/246‑1 (MQ=255) gCTTGTCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAg < 1:443909/235‑1 (MQ=255) cttatCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAGTGTATCAGCCGCttttt > 1:165815/5‑251 (MQ=255) atCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAGTGTATCAGCCGCttttttgt > 1:607322/2‑249 (MQ=255) gTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGTTTGCCGATTGTAGCGGATACACAACCCGAATCCCTCGTCGAAAAGTGTATCAGCCGCTTTTTTGTAg > 1:827565/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |